發(fā)簡信
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疑問1：Xena數(shù)據(jù)庫下載的counts數(shù)據(jù)和TCGA 下載的counts一致性1、下載xena中LIHC counts表達量數(shù)據(jù)注意：數(shù)據(jù)是經(jīng)過log2標準化的，需要你轉(zhuǎn)換
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轉(zhuǎn)錄組筆記（5）序列比對HISAT2：比對到基因組 TopHat首次被發(fā)表已經(jīng)是7年前，STAR的比對速度是TopHat的50倍，HISAT更是STAR的1.2倍。HI...
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轉(zhuǎn)錄組分析筆記（4）質(zhì)量控制
fastq-dump將sra數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成fastq格式for ((i=59;i<=62;i++));do fastq-dump --gzip --...
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轉(zhuǎn)錄組分析筆記（3）數(shù)據(jù)下載GEO數(shù)據(jù)庫格式2018-01-27_164221.jpg 參考的文章AKAP95 regulates splicing through sca...
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轉(zhuǎn)錄組分析筆記（2）軟件安裝
一、軟件安裝 A. conda 1.安裝miniconda miniconda官網(wǎng)： #下載 wgethttps://repo.continuu...
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轉(zhuǎn)錄組分析筆記（1）云服務(wù)器一、準備的材料 1.騰訊云，充值20； 2.軟件：WinCP、Xshell 二、建立服務(wù)器 1.注冊騰訊云賬號 2.自定義服務(wù)器 基礎(chǔ)配置（傳輸...