先上圖 （由于R識(shí)別不了“—”，自動(dòng)換為"."） *****代碼*****
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非度量多維尺度（NMDS）分析及R繪圖先上圖 注：填充顏色由AI處理。 （樣本和分組文件如下）（這里只是展示數(shù)據(jù)形式并不是原數(shù)據(jù)（分組名與代碼中不一樣）） vegan分析數(shù)據(jù) 行名樣本，列名物種，內(nèi)容豐度。 繪圖...
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宏基因組分箱（五）Metawrap計(jì)算Bin豐度導(dǎo)讀 用Metabat2分箱的方法見(jiàn)：宏基因組分箱（二）Metabat2分箱實(shí)戰(zhàn)[http://m.itdecent.cn/p/72a60906d9a7]。本篇將展示用...
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TCGA數(shù)據(jù)下載一丶利用R語(yǔ)言GDCRNATools包進(jìn)行下載 安裝GDCRNATools包首先在Rstudio里設(shè)置清華鏡像。 然后再用GDCRNATools的gdc-client下載RN...
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samtools問(wèn)題當(dāng)用samtools將bowtie2比對(duì)的sam文件轉(zhuǎn)化為bam文件時(shí)遇到問(wèn)題： samtools: error while loading shared libraries...
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diamond比對(duì)以及結(jié)果數(shù)據(jù)處理
利用diamond比對(duì)數(shù)據(jù) 注意：diamond在無(wú)root權(quán)限的linux運(yùn)行比對(duì)命令時(shí)需要加參數(shù)-t /dev/shm創(chuàng)建臨時(shí)文件 注意事項(xiàng):默認(rèn)參數(shù)主要是針對(duì)段短序列，...
