適用于多個(gè)樣本合并分群之后想要再次修改樣本名稱
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
-
@落英神劍_bd12 我用軟件自帶數(shù)據(jù)沒(méi)有遇到這樣的情況，所以不太清楚
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering
SCENIC是一種基于單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其相關(guān)細(xì)胞狀態(tài)的工具 這里介紹的步驟方法是針對(duì)在R環(huán)境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
-
@校童 括號(hào)后面是轉(zhuǎn)錄因子作用的靶基因
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering
SCENIC是一種基于單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其相關(guān)細(xì)胞狀態(tài)的工具 這里介紹的步驟方法是針對(duì)在R環(huán)境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
-
@小丑先生_0514沒(méi)有哦，不過(guò)畫這個(gè)圖只需要兩列信息，一列基因，一列l(wèi)ogFC
畫一個(gè)有標(biāo)簽的火山圖—標(biāo)出顯著變化的基因
參考：ggplot2繪制火山圖實(shí)例 還可以添加title 用點(diǎn)的面積表示abs(logFC)的大小
-
-
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and ClusteringSCENIC是一種基于單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其相關(guān)細(xì)胞狀態(tài)的工具 這里介紹的步驟方法是針對(duì)在R環(huán)境中（GENIE3），主要是GENIE3/GRNBoost...
-
@我是劉小逗 一般用的是Seurat對(duì)象
Monocle擬時(shí)間分析
Monocle可以進(jìn)行下面三種類型的分析，可以與seurat無(wú)縫連接： 1 對(duì)細(xì)胞進(jìn)行聚類、分組和計(jì)算；2.進(jìn)行擬時(shí)間分析；3.差異表達(dá)分析； 2.Constructing ...
-
簡(jiǎn)書不再更新，個(gè)人主頁(yè) <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fkaopubear.top" target="_blank">https://kaopubear.top</a> 郵箱聯(lián)系 hi@kaopubear.top
-
Monocle擬時(shí)間分析Monocle可以進(jìn)行下面三種類型的分析，可以與seurat無(wú)縫連接： 1 對(duì)細(xì)胞進(jìn)行聚類、分組和計(jì)算；2.進(jìn)行擬時(shí)間分析；3.差異表達(dá)分析； 2.Constructing ...
-
PCA主成分分析實(shí)戰(zhàn)和可視化 | 附R代碼和測(cè)試數(shù)據(jù)一文看懂PCA主成分分析中介紹了PCA分析的原理和分析的意義(基本簡(jiǎn)介如下，更多見(jiàn)博客)，今天就用數(shù)據(jù)來(lái)實(shí)際操練一下。 在生信寶典公眾號(hào)后臺(tái)回復(fù)“PCA實(shí)戰(zhàn)”，獲取測(cè)試數(shù)據(jù)。...
-
【ComplexHeatmap包學(xué)習(xí)筆記】2.5 Seriation從學(xué)習(xí)用OncoPrint畫基因組突變的“瀑布圖”，發(fā)現(xiàn)顧博士創(chuàng)造的ComplexHeatmap是非常強(qiáng)大的一個(gè)包。 顧博士在他的GitHub上展示了這個(gè)強(qiáng)大的包在分析基因組...
