很久沒有這么大體量的搞過數(shù)據(jù)了。最近在整理cellbin，真的整的我心累。 一般情況下是直接創(chuàng)建conda 環(huán)境，然后寫一大堆模型和函數(shù)，你在這個環(huán)境里面使用就行。這個cel...
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Stero_seq單細(xì)胞處理工具cellbin2使用
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在不同環(huán)境下使用trackpy
直接打開 moniconda 使用 conda install 安裝了trackpy package。 那么我就是安裝在了base環(huán)境下面。 想要成功加載trackpy ...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://m.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時間序列分析（Pseudot...
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Cellranger原理介紹（上）
Cell Ranger 軟件是 10X genomics 官方提供的配套分析軟件，相信使用過 10X genomics 平臺進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析的老師們對它一定不陌生...
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2021-04-15小白安裝單細(xì)胞軟件CellPhoneDB安不上，報錯h5py，一步步解決背景 單細(xì)胞分許需要的其他軟件或R包都通過conda安裝好了，最后只剩CellPhoneDB了。有了iTALK的經(jīng)驗之后，我有了一點信心：報錯不要緊，我一個一個解決。 第一步...
