前面說了cellranger安裝和一些簡單的使用，我們繼續(xù)看一下cellranger的結(jié)果。一文學(xué)會單細胞轉(zhuǎn)錄組的CellRanger（一） - 簡書 (jianshu.co...
IP屬地：四川
-
一文學(xué)會單細胞轉(zhuǎn)錄組的CellRanger（二） -
sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程: Using sctransform in Seurat本教程介紹了Seurat包與sctransform 包一起分析時候的一般方法。首先你也許會問：sctransform包是用來干嘛的？ 這是一個值得關(guān)心和探討的問題，我也將做一...
-
Seurat的打分函數(shù)AddMouduleScore在讀張澤民老師發(fā)表的新冠文獻的時候看到計算免疫細胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函數(shù)...
-
秘籍 | 驚了，使用aspera下載SRA數(shù)據(jù)速度高達 291Mb/s
2024年5月20日更新：目前大家可以參考這篇??，更加方便：生信 | 超便捷！iSeq同時支持快速下載GSA/SRA/ENA的數(shù)據(jù)[https://www.jianshu.c...
-
Rcis Target：基因集找其調(diào)控因子和motif寫在前面：今天學(xué)習了Rcis Target這個包，每一次在學(xué)習一個包之前，苦惱和痛苦是不知道這個R包用來do for what？why to do？今天看了https://w...
-
circos圖在單細胞數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用前情回顧： Network在單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用[http://m.itdecent.cn/p/23e46ad14a3e]?；鶊D在單細胞數(shù)據(jù)探索中的應(yīng)用[htt...
