@Serissajaponica 1. https://harrier.nagahama-i-bio.ac.jp/sosui/sosuisignal/sosuisignal_submit.html；2. https://services.healthtech.dtu.dk/service.php?SignalP-5.0
亞細(xì)胞定位的愛恨情仇：核、質(zhì)之爭一、背景介紹 亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)簡介 ??1974年，阿爾伯特·克勞德（Albert Claude）因其在細(xì)胞結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)上的研究和發(fā)現(xiàn)獲得諾貝爾獎。亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)，是比細(xì)胞結(jié)構(gòu)更細(xì)...
@5145 我不知道你有沒有包括MSA比對，帶這個的話這已經(jīng)很快了。你可以像我文中介紹的，把每一步的耗時算出來，只有RosettaTR.py步驟用到GPU，如果是其他步驟耗時，I/O大多是主要原因，CPU影響也大，換固態(tài)硬盤。
RoseTTAFold-蛋白質(zhì)預(yù)測的“平凡之路”在個人筆記本win10自帶子linux系統(tǒng)下，運行基于CPU運算的RoseTTAFold 避開uniref30、BFD這兩個超大數(shù)據(jù)包的下載及解壓 提供便捷的pyRosett...
@lmylalala 網(wǎng)址調(diào)整了：http://www.liuzhen106.com/tools/103_2.html
密碼子優(yōu)化??在大腸桿菌中進(jìn)行異源蛋白質(zhì)的表達(dá)時，有時會發(fā)現(xiàn)重組蛋白質(zhì)的表達(dá)量很低，給后面的分離純化造成很大的困難。有些技術(shù)人員可能比較困惑，表達(dá)的蛋白質(zhì)不是毒蛋白，載體是商用載體，一...
@Pluto_506f 后臺服務(wù)器供應(yīng)商更換IP了，正在跟他們反饋。
分子克隆輔助小工具最近幾期的文章介紹了一些輔助分子克隆實驗的小工具，雖然功能很簡單，還是費了很大功夫編寫，最近確實很忙，不過趁周末終于把他們肝完了，本篇就對這些小工具做一個匯總，以暫時結(jié)束本系...
一、引子 ??2005年，Wigge等【1】在《Science》上報道了擬南芥“誘導(dǎo)開花”的信號調(diào)控通路，簡言之：在擬南芥體內(nèi)，一個叫做FLOWERING LOCUS T (...
細(xì)胞培養(yǎng)，看似簡單的一個實驗，卻不知道把多少英雄豪杰折磨的意欲“自掛東南枝”~今天科研小助手就為大家盤點一下細(xì)胞復(fù)蘇、傳代到凍存的一些步驟和注意事項，希望廣大科研汪能與細(xì)胞愉...
@ae93e489617d predict_e2e.py第115行
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@ae93e489617d 找到network/predict_pyRosetta.py，其中第81行的 window=150, shift=50 數(shù)值改小一些試試。
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@93a4cede354b 可以先學(xué)下Rosetta的系列教程，知乎上吳大佬有個中文系列的教程：https://zhuanlan.zhihu.com/rosettastudy?utm_source=wechat_session&;utm_medium=social&from=singlemessage，不懂的就去查資料，慢慢就通了。微信上關(guān)注“ROSETTA研習(xí)社”，里面有個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)方面知識的交流學(xué)習(xí)群，里面的大佬基本有問必答。祝你學(xué)業(yè)順利！
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@adxyz 你的配置肯定夠了。可能是配置的問題多些，兼容性。你用那個小的測試蛋白試試，如果沒問題就不是配置問題。另外注意下你的輸入序列，把換行去掉試試。
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我給的PyTorch的源有問題，激活RoseTTAFold環(huán)境后把下面這幾個按照以下版本重新安裝，使用 “rusty1s"頻道。
pytorch-cluster 1.5.9 py38_torch_1.9.0_cu111 rusty1s
pytorch-geometric 1.7.2 py38_torch_1.9.0_cu111 rusty1s
pytorch-scatter 2.0.8 py38_torch_1.9.0_cu111 rusty1s
pytorch-sparse 0.6.11 py38_torch_1.9.0_cu111 rusty1s
pytorch-spline-conv 1.2.1 py38_torch_1.9.0_cu111 rusty1s
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在個人筆記本win10自帶子linux系統(tǒng)下，運行基于CPU運算的RoseTTAFold 避開uniref30、BFD這兩個超大數(shù)據(jù)包的下載及解壓 提供便捷的pyRosett...
一、背景介紹 亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)簡介 ??1974年，阿爾伯特·克勞德（Albert Claude）因其在細(xì)胞結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)上的研究和發(fā)現(xiàn)獲得諾貝爾獎。亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)，是比細(xì)胞結(jié)構(gòu)更細(xì)...
忘記有多久沒有寫一些什么了，我不是一個擅長記錄生活細(xì)節(jié)的人，卻是一個擅長抽象邏輯思考的人。是要發(fā)揚自己的優(yōu)點到極致還是把補(bǔ)短作為主要任務(wù)？抑或是在了解、接受自己的優(yōu)缺...
DNA聚合酶（DNA介導(dǎo)的DNA聚合酶） T4 DNA聚合酶 概述：在模板及引物存在的條件下，T4 DNA聚合酶催化沿5′→3′方向合成DNA。此酶還具有3′→5′外切核酸酶...
當(dāng)前、以至于未來，研發(fā)人員必定成為科技企業(yè)的主要崗位，他們掌握著公司的命門。然而，研發(fā)人員的考核確實是難上加難。 木文所在企業(yè)、以及咨詢企業(yè)，都會根據(jù)企業(yè)特點調(diào)整和研究一些方...
1. 簡介 蛋白標(biāo)簽（Protein tag）技術(shù)是指利用基因克隆手段，將具有特定功能的多肽，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域，甚至完整蛋白質(zhì)與目標(biāo)蛋白融合在一起，以實現(xiàn)目標(biāo)蛋白的表達(dá)純化，檢測...
2013年左右，二代測試開始崛起，不到一年大有橫掃測序行業(yè)的勢頭。記得當(dāng)時二代測序服務(wù)公司的業(yè)務(wù)員到我們實驗室推銷業(yè)務(wù)，宣傳冊十分“高大上”的樣子，一問價格，內(nèi)心直哆嗦。但當(dāng)...
