--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具合集。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
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samtools的安裝和使用 -
干貨 | 一文教會(huì)你如何分析ATAC-seq數(shù)據(jù)
哈嘍大家好，好久沒有跟新啦，小編最近面臨博士三年級畢業(yè)的壓力，所以公眾號都沒時(shí)間打理了，不過偶爾還是能看到有人關(guān)注我的公眾號或者留言，還是很受鼓舞噠~所以還是想抽時(shí)間將之前學(xué)...
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如何將轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)mapping到自己的序列并可視化？(HISAT2+Samtools+IGV)以小編自己最近在做的HBV mapping為例，前期的環(huán)境部署及軟件安裝找時(shí)間再細(xì)說，直接進(jìn)入主題，如下： 前期準(zhǔn)備： Linux以及Windows操作系統(tǒng)，HISA...
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干貨 | 全基因組CRISPR文庫篩選數(shù)據(jù)分析——MAGeCKFlute近年來，全基因組CRISPR文庫篩選技術(shù)被廣泛應(yīng)用于腫瘤及病毒相關(guān)調(diào)控因子篩選。通過同時(shí)sgRNA文庫同時(shí)敲除全基因組的不同基因，經(jīng)流式或藥物篩選目的細(xì)胞表型，并擴(kuò)增sgRN...
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干貨 | 兩行代碼教你輕松搞定Linux系統(tǒng)中R以及RStudio的安裝Linux系統(tǒng)中安裝R： R可以在大多數(shù)桌面環(huán)境中使用，并且可以適用于不同的操作系統(tǒng)。對于Windows操作系統(tǒng)而言，安裝R十分的方便，通過訪問R官方網(wǎng)站，下載鏡像連接并下載...
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干貨 | 一文教會(huì)你如何使用VMware安裝CentOS虛擬機(jī)
在學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的過程中，不可避免的會(huì)經(jīng)常接觸到Linux系統(tǒng)，畢竟生物信息學(xué)軟件大多都是基于Linux系統(tǒng)開發(fā)的，尤其對于生物大數(shù)據(jù)的處理如原始FastQ數(shù)據(jù)的比對、組裝以...
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干貨 | 一文教會(huì)你如何采用Linux系統(tǒng)處理RNAseq測序數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)錄組是指細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和。轉(zhuǎn)錄組測序（Transcriptome sequencing）是基于Illumina HiSeq測序平臺檢測細(xì)胞內(nèi)所...
