根據(jù)浙科版高中生物學(xué)選修一38頁淀粉水解流程圖的描述，很容易讓人誤以為三者的作用底物分別為淀粉、糊精和麥芽糖，為了便于理解幾類淀粉酶的作用，先需要辨析兩組概念：直鏈淀粉與支鏈...
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α-淀粉酶、β-淀粉酶和糖化淀粉酶的區(qū)別
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泛基因組工具: Roary, panX, PEPPAN, PGAP引用文章標(biāo)題：Insights on the Evolutionary Genomics of the Blautia Genus: Potential New Specie...
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snakemake使用筆記
snakemake是一個(gè)用來編寫任務(wù)流程的工具，用python編寫的，因此其執(zhí)行的流程腳本也比較通俗易懂，易于理解。 一、從一個(gè)簡單的例子開始 1、安裝snakemake 安...
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Ubuntu 14.04 LTS安裝Git LFS
Git LFS是git支持大文件的一個(gè)工具。例如，大于100M的文件，多了之后用Git管理，經(jīng)常會卡死。從Git 1.8之后的版本開始支持。有了Git LFS，可以大幅度提升...
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VIRGO 和 VOG 數(shù)據(jù)庫使用教程（2）
Module 0：試運(yùn)行 VIRGO 本模塊概述了如何測試 VIRGO 以確保其按預(yù)期工作。在目錄 testrun 中包含測試數(shù)據(jù)集： 運(yùn)行 step1 和 step2 腳本...
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VIRGO 和 VOG 數(shù)據(jù)庫使用教程（1）
VIRGO網(wǎng)站：https://virgo.igs.umaryland.edu/[https://virgo.igs.umaryland.edu/]VIRGO 是人類陰道微生...
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FastQC下載及安裝
FastQC下載及安裝 FastQC是一個(gè)java軟件，下載后可以直接使用，免安裝編譯，但需要先配置java環(huán)境。 一、Java環(huán)境配置 首先，確定java是否已經(jīng)配置好。 ...
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組間差異檢驗(yàn)，終于有人講清楚了!什么是組間差異檢驗(yàn)？就是組間的差異分析以及顯著性檢驗(yàn)，應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)上的假設(shè)檢驗(yàn)方法，檢驗(yàn)組間是否有差異及其差異程度。坦率地講，所有的差異檢驗(yàn)都基于一個(gè)假設(shè)：組間沒有差異，變量之...
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代謝組差異代謝物分析簡介差異代謝物分析 差異代謝物分析包括多元統(tǒng)計(jì)分析和單維統(tǒng)計(jì)分析，其中多元統(tǒng)計(jì)能捕捉到具有相互關(guān)聯(lián)的差異性變量有利于代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究；單維的統(tǒng)計(jì)能獨(dú)立分析單個(gè)變量的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，在...
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理解OPLS-DA分析的原理和結(jié)果圖OPLS-DA：正交篇最小二乘法判別分析 原理： OPLS-DA不同于PCA，它是一種有監(jiān)督的判別分析統(tǒng)計(jì)方法。運(yùn)用偏最小二乘回歸建立代謝物表達(dá)量與樣本類別之間的關(guān)系模型，來...
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第2篇：太空輻射誘導(dǎo)小鼠腸道微生物和代謝組的多模態(tài)反應(yīng)摘要： 低劑量的、不會殺死細(xì)胞的輻射處理會對病理學(xué)的臨床表現(xiàn)造成強(qiáng)烈的影響，包括微生物和宿主基因表達(dá)的變化。盡管腸道微生物對維持人類身體健康的必要性已經(jīng)廣為人知，但是輻射對微...
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Kraken2物種注釋流程
1.創(chuàng)建工作目錄kraken2并進(jìn)入工作目錄 2.將去除引物和barcode的序列放入工作目錄，格式為.fastq 3.下載數(shù)據(jù)庫 4.解壓 5.注釋 6.獲得相對豐度
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Alpha多樣性指標(biāo)解讀
群落豐富度（Community richness）的指數(shù)：指一個(gè)群落中物種數(shù)目的多少 Chao指數(shù)：是用Chao1算法估計(jì)樣品中所含OTU 數(shù)目的指數(shù)，Chao1 在生態(tài)學(xué)中...
