在做單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時(shí)候，獲得分群后我們希望知道每個(gè)群的marker基因是什么以此來(lái)描述細(xì)胞群的特征。其技術(shù)本質(zhì)就是利用某種規(guī)則獲得樣本（高変基因）或者每個(gè)亞群（差異基...
發(fā)簡(jiǎn)信
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組WGCNA到底應(yīng)該怎么做？ -
ChIP-seq分析全記錄
一、背景知識(shí) CHIP-seq染色體免疫共沉淀技術(shù)。是研究==細(xì)胞內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)互作==就是將chip實(shí)驗(yàn)得到的dna拿來(lái)測(cè)序，再進(jìn)行下游分析。關(guān)鍵在于Chip實(shí)驗(yàn)。 Ch...
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[ 生信者們建議看看 1 ] Ming Tang: 我為生物信息學(xué)/數(shù)據(jù)科學(xué)課程選擇的書(shū)籍/ URL放在最前面的鏈接：My opinionated selection of books/urls for bioinformatics/data science curricu...
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Week27 — 單細(xì)胞綜述 012018-11.12-11.17 導(dǎo)讀： 在單細(xì)胞技術(shù)出現(xiàn)之前，測(cè)序材料通常是數(shù)百萬(wàn)甚至更多細(xì)胞的混合DNA樣本，這種方法雖然能夠得到全基因組序列信息，但是對(duì)其進(jìn)行研究得到的...
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Week5— 單堿基編輯技術(shù)
發(fā)展背景 隨著ZFN、TALEN、CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)的相繼出現(xiàn)，基因編輯技術(shù)逐漸變得更加簡(jiǎn)便、 高效， 并被廣泛應(yīng)用于基因功能、動(dòng)物模型、基因治療等研究。但...
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R包安利 ① easyPubMed—PubMed利器想讓這張圖當(dāng)封面 1.1 關(guān)于 easyPubMed 作者是 Damiano Fantini ，2019-03-29 發(fā)表，甩鏈接。 看它的 Title: 搜索和讀取 Pub...
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高通量測(cè)序數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)記錄（三）：Pathway Analysis及GSEAPathway Analysis討論及基因富集分析軟件（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）使用實(shí)戰(zhàn) 在所有物是人非的景色里，我最中意你。 背...
