https://blog.51cto.com/yijiaobani/2849460[https://blog.51cto.com/yijiaobani/2849460]
發(fā)簡信
IP屬地：福建
-
VS Code設(shè)置ctrl + enter執(zhí)行當(dāng)前行并自動跳轉(zhuǎn)到下一行 -
用ggplot2繪制小提琴圖+箱形圖序 本文記錄了：小提琴圖+箱形圖的繪制，箱形圖放置小提琴圖內(nèi)部，并進(jìn)行顯著性差異檢驗。成圖如下所示： 加載所需要的包 查看示例數(shù)據(jù) 成圖
-
dplyr包學(xué)習(xí)筆記我的總結(jié)： 按值篩選觀測，filter()。 按名稱選取變量，select()。 對行進(jìn)行重新排序，arrange()。 使用現(xiàn)有變量的函數(shù)創(chuàng)建新變量，mutate()。 將...
-
單細(xì)胞氣泡圖一、簡介 本文記錄了：單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中繪制氣泡圖 二、代碼部分 加載包 示例數(shù)據(jù)： 找差異基因，后續(xù)作圖用的基因。 默認(rèn)作圖 我的氣泡圖 經(jīng)挑選后要在熱圖中展示的基因 取出作...
-
Seurat::DotPlot繪圖美化-facet方法添加X軸注釋標(biāo)簽獲取Seurat氣泡圖的繪圖數(shù)據(jù) 創(chuàng)建x軸分類標(biāo)簽注釋 將注釋添加到data.usage方便繪圖調(diào)用 根據(jù)需求重排y軸繪圖標(biāo)簽順序 重繪氣泡圖并基于facet分面方法為x軸添...
-
OR計算單細(xì)胞組織偏好性輸入數(shù)據(jù)格式，第一行是樣本，第二行是細(xì)胞類型。 對樣本進(jìn)行分組，分為R組和NR組。 接下來開始分析 計算OR值 Inf設(shè)置為最大值4 這部分計算p值 接下來畫熱圖 附錄：
-
對各個細(xì)胞亞群在各個樣本中所占比例進(jìn)行秩和檢驗簡介 本文記錄了：對各個細(xì)胞亞群在各個樣本中所占比例進(jìn)行秩和檢驗，并保存為tiff圖像。 示例數(shù)據(jù)：PBMC 數(shù)據(jù)有3個樣本，9類細(xì)胞亞群。 取出細(xì)胞亞群和樣本。 計算細(xì)胞頻...
-
我的Python常用命令一、庫相關(guān) 1. 安裝庫，以安裝NumPy庫為例 2. 卸載庫 3. 導(dǎo)入庫 4. 查看指定庫，例如NumPy 5. 查看所有庫 二、路徑 1. 查看當(dāng)前路徑 2. 設(shè)置路徑...
-
TCellSI學(xué)習(xí)筆記本文記錄了：TCellSI這個工具的使用（R語言），平臺是Linux。TCellSI: A novel method for T cell state assessment ...
-
如何使用VS Code連接云服務(wù)器本文記錄了：如何使用VS Code連接云服務(wù)器；進(jìn)一步設(shè)置了，每一次登錄時無需再次“選擇平臺”和“輸入密碼”。 如何使用VS Code連接云服務(wù)器 安裝插件【Remote -...
-
-
生存分析中如何使用最佳閾值進(jìn)行分組本文記錄了：在生存分析中如何通過survminer包進(jìn)行最佳閾值分組。 1. 查看示例數(shù)據(jù)“myeloma” 2. 最佳閾值分組 對變量【DEPDC1】進(jìn)行最佳閾值分組（可同...
-
如何更改R包的安裝路徑本文記錄了：R包的安裝路徑默認(rèn)在C盤，如何更改【R包的默認(rèn)安裝路徑】，更改后如何恢復(fù)默認(rèn)。 1. 先查看當(dāng)前的R包的安裝路徑 2. 開始更改R包的安裝路徑 輸入以下代碼，打開...
-
-
ggplot2之設(shè)置x軸、y軸標(biāo)簽與x軸、y軸的距離本文記錄了：ggplot作圖如何設(shè)置x軸、y軸標(biāo)簽與x軸、y軸的距離；用于增大x軸、y軸標(biāo)簽與x軸、y軸的距離。 0. 加載【ggplot2】包 1. 示例數(shù)據(jù) 2. 默認(rèn)作...
-
ggplot2之設(shè)置繪圖區(qū)域邊框
本文記錄了：ggplot作圖如何加粗邊框的問題；修改這些參數(shù)除了加粗邊框，還可以有更多的效果。 0. 加載【ggplot2】包 1. 示例數(shù)據(jù) 2. 默認(rèn)作圖 3. 加粗邊框...
