您好，單拷貝直系同源基因，如果序列后面有*，在序列比對(duì)的時(shí)候，要?jiǎng)h除嗎？因?yàn)槲矣胮rank比對(duì)之后，*變成了X
基于OrthoFinder的結(jié)果提取直系同源單拷貝基因建樹0.運(yùn)行Orthofinder略 1.建樹 https://github.com/yongzhiyang2012/Two_iron_wood_genome_analysis/...
IP屬地：四川
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【搬運(yùn)】python按名字串聯(lián)多個(gè)序列
Using Biopython to concatenate (aligned) sequences with the same name (yueyvettehao.net...
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你好，系統(tǒng)發(fā)育樹有要求嗎？是需要帶有發(fā)育時(shí)間的樹，還是有枝長(zhǎng)的樹就可以
Hyphy，不亞于Paml的選擇壓力分析的優(yōu)秀軟件，使用指北
近幾年來，Hyphy的使用人數(shù)越來越來多，雖然不及paml，但這款軟件的一些優(yōu)秀特性使得它值得受到使用和關(guān)注。首先相比paml，hyphy有以下幾大優(yōu)點(diǎn)： 操作使用簡(jiǎn)單。 運(yùn)...
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查找感興趣的基因、基因組區(qū)域是否有調(diào)控元件的在線網(wǎng)頁工具EpiRegio
前幾天，Nucleic Acids Res新發(fā)了一篇文章，關(guān)于查找基因組調(diào)控元件的網(wǎng)頁在線工具EpiRegio：https://epiregio.de/。 具體來說，該工具有...
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主要關(guān)注于脊椎動(dòng)物適應(yīng)性進(jìn)化與比較基因組學(xué)研究<br>簡(jiǎn)書原賬號(hào)：WhyDoWeAge
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平凡的生信之路<br>HUBU<br>UCAS<br>NUS<br>PKU
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博主您好，第一行命令里的 singlecopyorthologues.txt是不是orthogroups_SingleCopyOrthologs.txt這個(gè)文件呀？
開放問題：如何從OrthoFinder2的Single_Copy_Orthologue_Sequences蛋白序列集提取CDS進(jìn)行正選擇分析
已有“OrthoFinder/Results_Jul11/Orthogroups ”
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您好，cat *.fa > hg.19.fa 大于號(hào)前面的數(shù)據(jù)是怎么得來的啊？
2022-04-21fa文件和gff文件提取cds序列并翻譯成蛋白
cat *.fa >hg19.fa #根據(jù)hg19.fa提取CDS序列 gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -y t...
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