一、Metascape簡介 Metascape（http://metascape.org/[http://metascape.org/]） 是一個(gè)功能強(qiáng)大的基因功能注釋分析工...
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Metascape 專門為生物學(xué)者設(shè)計(jì)的基因富集分析網(wǎng)站
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曹洋課題組 | Labshare 生物信息學(xué)在線軟件集錦記錄一個(gè)主頁曹洋課題組 | Labshare 生物信息學(xué)在線軟件集錦地址：http://www.labshare.cn/biosoft/index.html[http://w...
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TCGA-204-使用firehose網(wǎng)頁工具TCGA-204-使用firehose網(wǎng)頁工具 ucsc中的xena整理的數(shù)據(jù)非常全，但這個(gè)瀏覽器只能做感興趣的一個(gè)一個(gè)基因，當(dāng)我們沒有感興趣的基因怎么辦呢？ 谷歌搜索-fi...
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復(fù)現(xiàn)NC(三)| DEseq2+GO/KEGG富集分析本系列為 RNA-Seq 分析具體實(shí)現(xiàn)過程，將具體描述流程及可執(zhí)行代碼～本次復(fù)現(xiàn)文章來自 Nature communication，題目為：Temporal and Spa...
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RNA-Seq從入門到放棄
本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq數(shù)據(jù)分析流程 一、測序數(shù)據(jù)的介紹 測序數(shù)據(jù)主要有兩個(gè)來源 1、自測的測序數(shù)據(jù)；2、SRA數(shù)據(jù)庫下載；這里介紹SRA數(shù)據(jù)庫下載。 ...
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腫瘤外顯子全流程notesPart0背景知識 Q：什么是外顯子測序呢？A：外顯子組測序是指利用序列捕獲或者靶向技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA富集后再進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法。外顯子組包含約1%的...
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全外顯子測序數(shù)據(jù)分析TITLE: 全外顯子測序數(shù)據(jù)分析AUTHOR: Shuntai Yu [TOC] 外顯子是形成mRNA后剪接剩下的部分，包括UTR區(qū)與CDS，而CDS則是真正編碼蛋白的...
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TCGA樣本命名規(guī)則
在TCGA中，一個(gè)患者可能會對應(yīng)多個(gè)樣本，如TCGA-A6-6650可以得到3個(gè)樣本數(shù)據(jù)： TCGA-A6-6650-01A-11R-1774-07TCGA-A6-6650-...
