在單細胞轉錄組解析肥厚性心肌病發(fā)病機制[http://m.itdecent.cn/p/f270b9431427]里面看到計算某基因與其它基因的相關性 方法里寫的是這樣做...
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plot1cell：優(yōu)雅的可視化你的單細胞數據簡介 plot1cell包提供了多種單細胞數據可視化的高級功能，可以基于Seurat分析結果對象直接進行可視化繪圖，主要依賴于Seurat V4，circlize，Compl...
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全外顯子組測序（WES）分析3: 變異功能注釋（SnpEff / VEP ）1. 使用注釋 VCF 文件 1.1 下載和安裝 SnpEff 1.2 下載參考基因組數據庫 手動下載（選擇符合自己需要的物種及版本）：https://sourceforge...
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Variant Effect Predictor： Ensembl VEP的安裝、配置和使用
軟件說明 Ensembl VEP是一款突變注釋文件，但是相關的配置比較困難。這次我們使用conda進行安裝，可以跳過繁瑣的環(huán)境配置過程。http://asia.ensembl...
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R語言中的apply()，lapply()，sapply()，tapply()函數以及示例
文章來源：R中的apply（），lapply（），sapply（），tapply（）函數以及示例 本教程旨在介紹apply（）函數集合。apply（）函數是所有集合中最基本的...
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最全bcftools使用說明--只看本文就夠了1 簡介 BCFtools 是一款多種實用工具的集合，它可以用于處理VCF文件和二進制的BCF文件。它可以接受VCF格式、壓縮的VCF格式以及BCF格式，并能自動檢測輸入的格...
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2021-05-31Speedseq的安裝和使用（轉載待測試）
題外音：speedseq是一套流程，套用了大量三方軟件，但是居然也能發(fā)到Nature Methods上！驚訝之余查看了一下代碼，非常佩服，簡直是教科書一樣的模式，太贊了！ 1...
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全外顯子測序數據分析TITLE: 全外顯子測序數據分析AUTHOR: Shuntai Yu [TOC] 外顯子是形成mRNA后剪接剩下的部分，包括UTR區(qū)與CDS，而CDS則是真正編碼蛋白的...
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dplyr-cli：在Linux Terminal上直接執(zhí)行dplyr
熟悉R的朋友都會知道，dplyr包是對原始的數據集進行清洗、整理以及變換的有力武器之一。但是其使用會局限于你需要有打開R/R studio或者通過R腳本來執(zhí)行dplyr。對于...
