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【R】散點圖（二）數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)來源 使用的數(shù)據(jù)集mtcars是R自帶的數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)格式說明 該數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)類型為data.frame，一共有11列，每一列對應于汽車的...
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【R】散點圖（一）數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)來源 此次繪圖用的數(shù)據(jù)集是R自帶的數(shù)據(jù)集“iris”（鳶尾花數(shù)據(jù)集）。 數(shù)據(jù)格式解說 該數(shù)據(jù)集有5列數(shù)據(jù)，如果是要比較花萼長度（sep...
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畫一朵花前言 ?在母親節(jié)這天用R畫一朵這樣的花送給媽媽或許是一個不錯的選擇。下面將介紹詳細步驟。 首先需要安裝這些包 ggplot2 tidyverse...
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limma、DESeq2、edgeR差異分析及繪制韋恩圖不同的時空以及不同的條件下差異基因分析是RNAseq分析的重要目標。差異表達分析方法包括：基于Read數(shù)目：DESeq、limma和edgeR；...
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不同定量軟件的結(jié)果比對提取 分別用rsem,kallisto,Salmon定量得到每個樣本isoform的定量文件,提取了transcript_id一列和count一...
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RSEM進行轉(zhuǎn)錄本定量利用STAR完成了reads的比對，接下來使用rsem進行轉(zhuǎn)錄本定量。 Build References ?--gtf mouse_ref/ge...
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遞歸
遞歸分類 分解為直接量+小規(guī)模子問題不伴隨著參數(shù)角色的變化伴隨著參數(shù)角色的變化（調(diào)用遞歸時除了縮小參數(shù)，還要調(diào)換參數(shù)的位子） 分解為多個小規(guī)模子...
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位運算位運算符 例1：找出落單的數(shù)。 一個數(shù)組中除了某一個數(shù)之外，其他的數(shù)字都出現(xiàn)了兩次，請找出這個數(shù)字；【知識點】相等的數(shù)做異或被消掉了（A ^ A...
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STAR比對
建立索引 --genomeDir：索引目錄。（index_dir一定要是存在的文件夾，需提前建好）--genomeFastaFiles：基因組文...