一、中性學(xué)說 分子水平上，生物的演化或物種的進(jìn)化并不是自然選擇引起的，而是由中性/近中性的突變等位基因經(jīng)過遺傳漂變引起的，從而形成分子水平上的進(jìn)化性變化或種內(nèi)變異。分子演化的...
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群體遺傳學(xué)-選擇清除分析 -
本地Blast的安裝與使用
寫在前面 這一篇教程寫于很久之前，那時候才剛開始學(xué)著記錄下自己的學(xué)習(xí)過程，今天將其正式貼出來，供自己也供讀者參考。 Blast的安裝 說明：BLAST工具是由NCBI所提供。...
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野生稻基本知識
禾本科：Gramineae 稻屬：Oryza L. 尼瓦拉野生稻：Oryza nivara Sharma & Shastry 普通野生稻：Oryza rufipogon Gr...
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如何向NCBI的SRA上傳數(shù)據(jù)首先訪問SRA的提交界面，https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/，在沒有登陸NCBI時，網(wǎng)頁內(nèi)容如下所示 點擊Log in, 會進(jìn)...
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從參考基因組截圖指定位置的序列-M
目的：截取參考基因組特定區(qū)域的堿基序列 具體操作：1在已知參考基因組nip.fa的情況下，使用samtools faidx截序列 2截取位置 chr03:11100-1111...
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肖申克的救贖Hope is a good thing, 希望是好事 Maybe the best of things. 也許是人間至善 And no good thing ever di...
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使用ASMap構(gòu)建高密度遺傳圖譜在我大學(xué)的時候，構(gòu)建遺傳圖譜靠的是人工跑膠，然后看膠圖統(tǒng)計基因型。當(dāng)時我用的SSCP(單分子構(gòu)象多態(tài)性)技術(shù)區(qū)分單個堿基存在差異的等位基因，要放在4度過夜12小時，然后第二天...
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群體遺傳筆記（一）：群體間選擇信號的檢測及GO注釋從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控、比對，到calling snp獲得vcf文件這一步，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實踐（上），還有Samtools+bcf...
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ggpubr包系列學(xué)習(xí)教程(一)ggpubr: 'ggplot2' Based Publication Ready Plots 一款基于ggplot2的可視化包ggpubr，能夠一行命令繪制出符合出版物要求...
