榴蓮?fù)礎(chǔ)IDD SAIR 用 520 萬(wàn)個(gè) AI 生成的復(fù)合物結(jié)構(gòu)填補(bǔ)了數(shù)據(jù)鴻溝，但也無(wú)情地揭示了：我們離用預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)精準(zhǔn)預(yù)測(cè)結(jié)合力，還有十萬(wàn)八千里。 海量合成數(shù)據(jù)： SAI...
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IP屬地：廣東
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SAIR：AI 制藥的數(shù)據(jù)盛宴，還是畫(huà)餅充饑？
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ADMET 預(yù)測(cè)新范式：讓刪失數(shù)據(jù)變廢為寶
榴蓮?fù)礎(chǔ)IDD 通過(guò)學(xué)習(xí)分子對(duì)之間的性質(zhì)差異，這種新方法巧妙地繞過(guò)了藥物研發(fā)中普遍存在的"刪失數(shù)據(jù)"陷阱，顯著提升了 ADMET 預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。 核心創(chuàng)新是引入雙線性轉(zhuǎn)導(dǎo)（...
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AI 設(shè)計(jì)大環(huán)分子新藥：從代碼到活體，全程跑通
榴蓮?fù)?AIDD CycleGPT 模型成功實(shí)現(xiàn)了從 AI 設(shè)計(jì)、合成到動(dòng)物模型驗(yàn)證的全流程，證明了生成式 AI 在攻克大環(huán)分子這類高難度化學(xué)空間方面的巨大潛力。 Cycl...
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無(wú)需對(duì)接！Graph_RG 問(wèn)鼎 CASP16 親和力預(yù)測(cè)
榴蓮?fù)?AIDD Graph_RG 在 CASP16 奪冠，證明了拋棄“構(gòu)象”包袱的 AI 模型，在超大規(guī)模虛擬篩選上擁有壓倒性速度和實(shí)用價(jià)值。 顛覆性勝利：Graph_R...
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AI 當(dāng)審稿人？大語(yǔ)言模型篩選“老藥新用”靠譜嗎？
榴蓮?fù)?2014 大語(yǔ)言模型（LLM）能像初級(jí)研究員一樣，高效篩選“老藥新用”的潛在機(jī)會(huì)，但前提是你得像個(gè)老手一樣，知道該怎么“問(wèn)”它。 模型分工不同：GPT-4o 像個(gè)嚴(yán)...
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DDI 預(yù)測(cè)：扔掉圖網(wǎng)絡(luò)，用 Transformer 就夠了
想把藥物相互作用這事兒算準(zhǔn)，與其費(fèi)勁巴拉地去搭什么復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)，還不如老老實(shí)實(shí)找點(diǎn)真正有用的化學(xué)和臨床特征，喂給一個(gè)簡(jiǎn)單的分類器。 核心打法是數(shù)據(jù)融合：用 Transfor...
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AI 也想當(dāng)“絕命毒師”？我看還嫩了點(diǎn)
一幫大模型畫(huà)分子圖畫(huà)得是挺漂亮，但 ToxiMol 這面照妖鏡一亮，才發(fā)現(xiàn)它們想真正搞懂化學(xué)毒性這回事兒，基本上還處于穿開(kāi)襠褲的水平。 ToxiMol 這個(gè)基準(zhǔn)測(cè)試，頭一回給...
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Biomni：一個(gè) AI 包攬所有生物醫(yī)學(xué)研究？
斯坦福搞出的 Biomni，看起來(lái)像個(gè)無(wú)所不能的科研“瑞士軍刀”，但要說(shuō)它能獨(dú)立完成所有研究，我還是先泡杯咖啡冷靜一下。 野心巨大：Biomni 的目標(biāo)不是解決某個(gè)單一問(wèn)題，...
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PyMol ：精準(zhǔn)測(cè)量分子距離，讓你的結(jié)構(gòu)分析快人一步！榴蓮?fù)?2014 在結(jié)構(gòu)生物學(xué)的世界里，原子間的距離決定著相互作用的強(qiáng)弱，也蘊(yùn)藏著生命活動(dòng)的奧秘。而 PyMol 作為一款功能強(qiáng)大的可視化軟件，為我們打開(kāi)了通往微觀世界的大...
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PLIP: 如何分析蛋白質(zhì)和配體相互作用?榴蓮?fù)?2014 蛋白質(zhì)和配體之間的相互作用就像一把鑰匙開(kāi)一把鎖，只有完美契合才能發(fā)揮最佳效果。想要設(shè)計(jì)出高效的藥物，深入了解這些相互作用至關(guān)重要。 今天，我們將以 PD-...
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如何在 Pymol 中顯示蛋白表面電荷?榴蓮?fù)?2014 一、 蛋白質(zhì)表面電荷的重要性 蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要承擔(dān)者，其結(jié)構(gòu)與其功能息息相關(guān)。蛋白質(zhì)的表面電荷分布對(duì)其折疊、穩(wěn)定性以及與其他分子（例如其他蛋白質(zhì)、配...
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基于孟德?tīng)栯S機(jī)化的多發(fā)性硬化癥潛在蛋白藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)
榴蓮?fù)?2014 導(dǎo)讀 通過(guò)孟德?tīng)栯S機(jī)化分析發(fā)現(xiàn)，F(xiàn)CRL3、TYMP、AHSG、MMEL1 和 SLAMF7 是多發(fā)性硬化癥的新藥物潛在靶標(biāo)。 作為一種復(fù)雜的自身免疫病，...