m6A甲基化是轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中重要的表觀遺傳修飾方式，它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq（高通量測(cè)序法）作為m6A修飾的檢測(cè)方法，其具有針對(duì)全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)m6A...
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RNA甲基化修飾m6A檢測(cè)熱門技術(shù)—MeRIP-seq -
MeRIP-Seq流程MeRIP-Seq流程圖如下： 1 數(shù)據(jù)下載 注意事項(xiàng)：Aspera不能在root權(quán)限下安裝，必須新增加一個(gè)普通用戶才安裝，一般安裝在/home/user/下，安裝完成后將下...
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KEGG API 與 iPATH3 批量繪制通路圖
7.1 更新內(nèi)容 偶然發(fā)現(xiàn)有人寫了個(gè)包，直接用就行，很方便，就是保存文件有點(diǎn)小bug點(diǎn)擊鏈接跳轉(zhuǎn)用法：下載全部文件，在下載目錄操作就行。注：需要提前安裝svgutils包 參...
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讀《醫(yī)學(xué)微生物組實(shí)戰(zhàn)指南》|| 或一瞥單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析記得小時(shí)候掉到餐桌上的小丸子，再抓起來(lái)吃的話，大人會(huì)打手手，并告知上面有細(xì)菌哦。這是對(duì)微生物最開始的認(rèn)識(shí)，雖然沒有像”化學(xué)物品“那么可怕，但是微生物似乎和不干凈聯(lián)系到一起。直...
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讀《來(lái)自基因組的一些數(shù)學(xué)》本書是郝柏林老師（1934年6月26日—2018年3月7日）在生物信息學(xué)領(lǐng)域工作的一些思考，郝先生是著名的理論物理學(xué)家，在六十幾歲（1997）轉(zhuǎn)向理論生命科學(xué)領(lǐng)域研究，而且在...
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抓住一點(diǎn)瑣碎小范！小鄭！大劉！ 曾經(jīng)的西溪小分隊(duì)， 也就我們仨兒兜兜轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)，又回歸一個(gè)人。 沒有人再叫“ 小范”、“小鄭”和“大劉”了！ “范老師！” “鄭老師！” “劉老師！” 你好！ ...
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2018-08-20 Metagenome分析教程
前言 之前看panda姐的blog時(shí)，發(fā)現(xiàn)介紹了篇關(guān)于Metagenome的分析教程，剛好就想著試著翻譯下，作為我的第一篇文章，順帶練練我MarkDown語(yǔ)法的訓(xùn)煉吧。 In...
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