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發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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R語(yǔ)言PCA畫(huà)圖 -
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繪制PCA圖以及生物學(xué)重復(fù)的相關(guān)問(wèn)題
很久沒(méi)有跟新啦~~~忙著基金。?；稹?。還是基金，然后就是文章。。文章。。還是文章。終于有空整理之前的東西。 說(shuō)繪圖方法之前先要了解，轉(zhuǎn)錄組的PCA圖的意義是什么？為了檢測(cè)樣...
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R 穩(wěn)健PCA分析穩(wěn)健PCA，就是一種通過(guò)構(gòu)造穩(wěn)健的均值向量和穩(wěn)健的協(xié)方差矩陣的主成分分析方法，其目標(biāo)是從輸入矩陣中去除稀疏缺失并獲得低秩近似，可以有效消除數(shù)據(jù)集中異常值的影響和提高尋找大型數(shù)...
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【R>>ssGSEA】制作GSEA需要的gmt文件GSEA文件有8類基因集，基本上可以解決80%-90%用到的問(wèn)題，當(dāng)然，我們都還有個(gè)性化需求，這個(gè)時(shí)候就需要我們自己動(dòng)手啦。先來(lái)觀察下GSEA需要的gmt文件格式(h.all...
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NBIS系列單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)匯總Single cell RNA-seq analysis workshop 該系列課程由瑞典國(guó)家生物信息學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施(NBIS) 負(fù)責(zé)設(shè)置，為瑞典Phd學(xué)生，博士后，研究人員和...
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RNA-Seq：差異表達(dá)分析案例白利合子酵母菌在乙酸或銅脅迫下早期反應(yīng)的轉(zhuǎn)錄譜分析 摘要：醋酸在食品工業(yè)和生物技術(shù)中是非常重要的微生物抑制化合物，而非傳統(tǒng)酵母種白利合子酵母菌對(duì)醋酸有顯著的耐受性。Zbhaa...
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非模式藍(lán)細(xì)菌物種注釋包構(gòu)建更新于2021.4.9又寫(xiě)了一個(gè)script，用來(lái)一次性構(gòu)建多個(gè)物種包的。成功倒是成功了，就是可能效率比較低。主要是用了for循環(huán)，然后用列表分別存儲(chǔ)各自物種的數(shù)據(jù)的。可能還...
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R|可視化|morris配色William Morris的方案按照世界名畫(huà)的配色進(jìn)行選取，特別適合在sci文章中進(jìn)行展示。 安裝[#%E5%AE%89%E8%A3%85] 所有的顏色都用magick和i...
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R包做主成分分析（含實(shí)例）注：內(nèi)容非原創(chuàng)，來(lái)自對(duì)網(wǎng)站http://www.sthda.com/english/articles/31-principal-component-methods-in-r-...
