本章我們開始學(xué)習(xí)概率圖模型，這里先做個(gè)簡單的開篇。 概率圖模型所涉及到的知識(shí)點(diǎn)非常廣，所以對(duì)讀者的基礎(chǔ)知識(shí)要求也相對(duì)較高。通過學(xué)習(xí)概率圖模型可以進(jìn)一步鞏固機(jī)器學(xué)習(xí)的相關(guān)知識(shí)儲(chǔ)...
發(fā)簡信
IP屬地：西藏
-
-
SRA Toolkit安裝以及配置流程先反思之前的問題： 之前下載了SRA數(shù)據(jù)后，進(jìn)行分割，運(yùn)行如下命令 /home/whu/program_and_files/sratookit.2.10.0/bin/fast...
-
《五種時(shí)間》讀后感
前兩天回家了，電腦在跑著實(shí)驗(yàn)，有點(diǎn)無聊，所以順手寫一寫《五種時(shí)間》的讀書筆記吧。 這本書還不錯(cuò)，可以讓人理性地看待自己的時(shí)間分配。通過五種時(shí)間的角度，反思自己一小時(shí)、一天、一...
-
[譯] 高斯混合模型 --- python教程本文翻譯自https://jakevdp.github.io/PythonDataScienceHandbook/05.12-gaussian-mixtures.html 上...
-
使用Pysam操作BAM文件
Pysam操作BAM文件 Pysam包是一個(gè)處理基因組數(shù)據(jù)的python模塊，它打包了htslib-1.3、samtools-1.3 和 bcftools-1.3的核心功能，...
-
2020-11-06隨筆
從現(xiàn)在到年底，完成兩件事。 一是完成第一個(gè)創(chuàng)新點(diǎn)，并最近投出文章。 二是完成第二個(gè)創(chuàng)新點(diǎn)。 其實(shí)，文章早在7月份就寫好了，由于疫情會(huì)議延期。最近被打了回來，chair說有兩個(gè)...
-
啦啦啦Leo ·請(qǐng)想要使用批量計(jì)算的讀者 查看DoAbsolute包，https://github.com/ShixiangWang/DoAbsolute，如果有相關(guān)文章發(fā)表，請(qǐng)引用或致謝，謝謝~
王詩翔 評(píng)論自解析ABSOLUTE軟件 -
解析ABSOLUTE軟件
簡介ABSOLUTE ABSOLUTE是Broad研究所開發(fā)的一款癌癥CNV分析軟件，實(shí)質(zhì)是一個(gè)R包，可以定量細(xì)胞的絕對(duì)拷貝數(shù)、腫瘤純度與倍性，如果提供突變數(shù)據(jù)，還能探究克隆...
-
分析ABSOLUTE數(shù)據(jù)結(jié)果
在解析ABSOLUTE軟件一文中我簡單介紹了ABSOLUTE軟件，因?yàn)锳BSOLUTE解的多樣性，這篇文章主要聚焦于ABSOLUTE結(jié)果的解讀，對(duì)象是結(jié)果圖。 主要的參考資料...
-
01 集成學(xué)習(xí) - 概述、Bagging - 隨機(jī)森林、袋外錯(cuò)誤率這幾章我們聊聊集成學(xué)習(xí)，集成學(xué)習(xí)算法是目前為止我們?cè)谙嗤卣鳁l件下做特征工程時(shí)，建立模型評(píng)分和效果最好的算法。比之前講過的線性回歸、Logist回歸、KNN、決策樹的評(píng)分效果...
-
用python做生物信息數(shù)據(jù)分析（2-pysam）寫perl的思維，可能確實(shí)不能拿來學(xué)python。畢竟，python的褲子有很多。面向?qū)ο蟮恼Z言，如果不好好穿褲子，怎么找對(duì)象？。手上要做的事情，需要解析sam，更或者bam...
-
不就畫個(gè)火山圖嗎？有那么難嗎？寫在前面 Emmm....課題組昨天開小組會(huì)了?；诓?dǎo)的建議與提醒，我又開始跳下來看生物學(xué)問題。在當(dāng)前課題的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)里面，我們總共有70個(gè)樣品，于是我寫了一個(gè)循環(huán)做了每個(gè)樣...
-
2019-07-20
我很傷心。 前些天，有朋友幫忙給學(xué)校的小貓找了領(lǐng)養(yǎng) 昨天把小貓交接到了新主人手上 昨天很開心，想著小貓終于有個(gè)歸宿了，以后口糧或者生病打針什么都不愁了 然而，今天貓貓主人去上...
-
2019-07-12 暑假工作第一天
一周前，姥爺病逝，回家一周，昨天晚上回到西安。 09:00到教研室，一邊吃早飯一邊愣神。確實(shí)，過去一周就像做夢(mèng)一樣。 記得回到家的那天下午，直接去了姥姥家。走到姥姥村口，眼淚...
