在進(jìn)行GWAS分析之后呢，我們通常會通過LD clumpping得到lead SNP，然而這些lead SNP在基因組中會與其他SNP有比較強(qiáng)烈的連鎖，這時就需要我們以圖的形...
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2025-05-02 | GWAS分析-包含LD信息的Locuszoom圖的繪制 -
跟著Nature Communications學(xué)作圖：R語言ggtern包畫三元相圖（Ternary plots ）論文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...
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文獻(xiàn)分享 | Nat Genet：常見 SNP 可以解釋人類身高的大部分遺傳因素●英文題目：《Common SNPs explain a large proportion of the heritability for human height》 ●期刊...
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組會論文 | Nat Genet：大規(guī)模多性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定數(shù)百個青光眼風(fēng)險位點(diǎn)《Large-scale multitrait genome-wide association analyses identify hundreds of glaucoma ...
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2024-11-30 | 群體遺傳變異——SNP及INDEL calling進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析的前提是我們得得到變異信息，之前已經(jīng)介紹了如何進(jìn)行CNV的識別，那么本文來介紹下如何識別基因組中分布更多、更常見的變異SNP（INDEL順帶） 二代測序 r...
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2024-10-16 | GWAS數(shù)據(jù)SNP rsID的注釋
當(dāng)我們拿到某個研究的GWAS summary data時，因為大多是二代測序的緣故，它的SNP ID可能不是正常的rsid，但是，我們下游有些分析卻要用到rsid，這時我們會...
