The genetic causes of convergent evolution[https://www.nature.com/articles/nrg3483] 要點 ...
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趨同演化 2025-08-19
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譜系速率多樣化BAMM 分析 2025-03-29RevBayes[https://revbayes.github.io/tutorials/divrate/ebd.html]需要進一步的研究 使用BAMM估算分化速率[ht...
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ASE（等位基因特異性表達） —— 完整流程
前段時間，接了老師一個等位基因特異性表達的任務(wù)，前后再加上其他的分析帶著做，再捋流程，拖拖拉拉也用了小一個月，終于從原始測序數(shù)據(jù)，得到了最終的那張table，具體的內(nèi)容基本已...
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每周文獻|NLR蛋白揭示免疫通路與干旱通路共進化當(dāng)下的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中，每年都會遭受來自生物或非生物脅迫帶來的損失。想要挽回?fù)p失，進行作物抗性育種，就迫切需要理解植物對于外界脅迫的響應(yīng)。植物細胞內(nèi)NLR蛋白是一類識別病原微生物效...
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全基因組水平上NLR pair鑒定
1 NLR pair定義 NLR pair(NLR 功能對)，是在染色體上有著明顯“頭對頭”排列特征，兩個基因協(xié)同調(diào)控免疫反應(yīng)，其中起識別效應(yīng)蛋白作用的基因稱為Sensor，...
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關(guān)于多基因組CRE-orthologues鑒定
對于多基因組CRE鑒定，文獻給予了方法， To identify orthologues of the 52,169 sugar glider candidate cis-r...
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Dfoil - 推斷祖先基因流-2. 在一篇講泥炭蘚的MBE看到了dfoil的使用 《Extensive Genome-Wide Phylogenetic Discordance Is Due to In...
