設(shè)計(jì)dCAPS標(biāo)記及dCAPS標(biāo)記酶切產(chǎn)物電泳實(shí)驗(yàn) dCAPS標(biāo)記的使用原理，如圖A（參考NCBI）所示： 可以簡單的理解為：在wild的片段中含有酶切位點(diǎn)，能被特異的切開，...
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設(shè)計(jì)dCAPS標(biāo)記及其酶切產(chǎn)物產(chǎn)物電泳區(qū)分的實(shí)驗(yàn) -
生信小白如何做出美美的多序列比對圖
前言做生信的小朋友看到別人文章里面的多序列比對圖是不是感覺特別好看，特別養(yǎng)眼，但是讓自己去做，出的圖真是慘不忍睹，無法直視，被老板ds，沒辦法，因?yàn)槟銈儧]有找到好用的軟件，還...
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RNA-seq之安裝Hisat2--Samtools--FeatureCounts--Stringtie
引言：以下學(xué)習(xí)筆記主要參考《一文學(xué)會常規(guī)轉(zhuǎn)錄組分析》“http://m.itdecent.cn/p/bdeebd669eb8” 1.數(shù)據(jù)獲取及質(zhì)控 提前安裝Strato...
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兩個(gè)物種及多個(gè)物種共線性分析——TBtools———— 奮斗沒有終點(diǎn)，任何時(shí)候都是起點(diǎn)（來源于網(wǎng)絡(luò)） 物種間共線性文件，只需要用TBtools就可以完美解決 1.下載好物種的基因組文件與gff注釋文件 打開One Ste...
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零基礎(chǔ)快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM...寫在前面 早前已經(jīng)推過《新手eggNOG-Mapper詳細(xì)教程》，但仍然有很多人遇到使用問題。換句話，可能那個(gè)教程不能徹底解決大伙遇到的問題。于是我決定寫一個(gè)完美的教程，徹底...
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一個(gè)階段的總結(jié)
這里是佳奧！哈哈，隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)的結(jié)束，我的假期也到了盡頭。馬上開學(xué)了，一名研一新生。 大四的時(shí)候課題組有師姐去培訓(xùn)了RNA-Seq，回來開的組會里面講了一遍流程，對于...
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轉(zhuǎn)錄組分析--FPKM與TPM
counts矩陣的構(gòu)建 FPKM/RPKM (Fragments/Reads Per Kilobase Million ) 每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬映射讀取的Fragment...
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GO富集分析打開Rstudio，依次輸入以下腳本 Module_GO文件： #setwd("C:/Users/86176/Desktop")#library(grid)#library(...
