劉小澤寫于19.3.30我們肯定都遇到許多利用坐標(biāo)去處理范圍信息的需求，比如要定位基因組的某個位置，這個位置可能代表了gene model 、genetic variants...
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一起來了解一下基因區(qū)間RangeData -
PsRobot的使用流程 | 小麥篇
???本文記錄我使用PsRobot的psRobot_tar模塊識別靶基因的過程。踩了不少坑，供實驗室?guī)煹軒熋脗兘梃b學(xué)習(xí)。本文參考： PsRobot: a web-based ...
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R語言繪圖包09--序列分析圖的繪制ggseqlogoR語言繪圖包系列： R語言繪圖包01--優(yōu)秀的拼圖包patchwork[http://m.itdecent.cn/p/e57555d48c91] R語言繪圖包02--熱...
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分子生物學(xué)實驗雜談01
說明書背后的基本原理 對于初步接觸分子生物實驗的同學(xué)，給出幾點建議： 首先是跟著實驗室的師兄師姐學(xué)習(xí)經(jīng)驗，經(jīng)驗往往是數(shù)次實驗成功或失敗的經(jīng)驗總結(jié)。 認真研讀產(chǎn)品說明書，這是一...
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基因組組裝和注釋理論基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是：是指將一條序列分成包含k個堿基的子字符串，如果reads長度為L，k-mer長度設(shè)為k，則產(chǎn)生的...
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R語言宏基因組學(xué)統(tǒng)計分析學(xué)習(xí)筆記
3.4 微生物數(shù)據(jù)組成分析 早在1897年，皮爾遜就警告說，在器官測量中使用兩個絕對測量值的比值，可能會形成“偽相關(guān)”。自1920s以來，地質(zhì)學(xué)的研究人員已經(jīng)知道，使用標(biāo)準(zhǔn)的...
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日常 | 2022-04-27 | 讀博之前應(yīng)該知道的二十件事情
原文：Twenty things I wish I’d known when I started my PhD[https://www.nature.com/articles...
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perl語言學(xué)習(xí)系列-----map、grep函數(shù)處理數(shù)組
由于在代碼中經(jīng)常用到foreach循環(huán)遍歷數(shù)組，perl中還存在兩個更為簡單的遍歷數(shù)組的函數(shù)。 1.map函數(shù) a.語法規(guī)則 語法：map EXPR,LIST或map BLO...
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Perl編程練習(xí)—雙重哈希、哈希數(shù)組
前幾天晚上在練習(xí)Perl編程時突然頓悟了以前一直迷惑的哈希數(shù)組。對這一類的問題的解決瞬間開拓了新思路。這兩天利用雙重哈希/哈希數(shù)組解決了一些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換中的一些小問題。記錄分享一...
