@Caspare 可以呀
使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variantsGATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點的流程，但這個示意圖比較簡潔，實際操作時一不小心就會報錯，故經(jīng)過探索，記錄下這個流程的細節(jié)以及半自動化的腳本。 1. 軟件...
發(fā)簡信
IP屬地：河南
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@Caspare 如果測序質(zhì)量很好的話不進行BQSR沒關系的 至于VQSR 其實是對變異過濾的方法 一般在基因組測序分析的時候用 RNAseq分析流程中 GATK官方給出的流程是用硬過濾的方法
使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variants
GATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點的流程，但這個示意圖比較簡潔，實際操作時一不小心就會報錯，故經(jīng)過探索，記錄下這個流程的細節(jié)以及半自動化的腳本。 1. 軟件...
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@J_445a 主要看后續(xù)研究目的吧 我們課題不太關注intron上的變異 所以就沒管他們
使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variants
GATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點的流程，但這個示意圖比較簡潔，實際操作時一不小心就會報錯，故經(jīng)過探索，記錄下這個流程的細節(jié)以及半自動化的腳本。 1. 軟件...
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使用GATK從RNA-seq數(shù)據(jù)中call variantsGATK官方給出了從RNA-seq數(shù)據(jù)中尋找變異位點的流程，但這個示意圖比較簡潔，實際操作時一不小心就會報錯，故經(jīng)過探索，記錄下這個流程的細節(jié)以及半自動化的腳本。 1. 軟件...
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面試官的話等于有沒有在服務器上裝過軟件？
服務器 | 又雙買了一個服務器
第一個服務器：2016.10 第二個服務器：2018.12 配置流程及問題： 從服務器聯(lián)系購買，配置，到網(wǎng)絡搭建（固定id，同一個路由），到主要分析環(huán)境搭建，基本上都是我一手...
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