加載所需R包 設(shè)置工作路徑 構(gòu)建測試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類后的順序輸出
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解決matplotlib中的Invalid DISPLAY variable錯(cuò)誤
在本地pyplot畫圖可以運(yùn)行，但是在服務(wù)器顯示以下錯(cuò)誤： 其實(shí)這是因?yàn)閙atplotlib是默認(rèn)畫圖backend是TkAgg，這個(gè)需要有GUI的圖形界面。只需要指定不需要...
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ATAC-seq分析干貨-2
作者 | Arno審稿 | 童蒙編輯 | amethyst 上一期我們介紹了ATAC-seq相關(guān)的背景知識(shí)。ATAC-Seq能幫助我們從全基因組范圍內(nèi)推測可能的開放染色質(zhì)位點(diǎn)...
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matplotlib圓環(huán)圖/餅圖顯示比值構(gòu)建一個(gè)顯示的數(shù)值的函數(shù)，將plt.pie中的autopct=該函數(shù)即可。 代碼： 生成圖：
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scHCL || 鑒定人的單細(xì)胞數(shù)據(jù)細(xì)胞類型
以自己的seurat對(duì)象的分群來鑒定細(xì)胞類群 參考：https://github.com/ggjlab/scHCL[https://github.com/ggjlab/scHCL]
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ggplot重新畫seurat對(duì)象的聚類圖
參考：https://stackoverflow.com/questions/59101791/seurat-dimplot-highlight-specific-group...
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jupyter配置代碼自動(dòng)補(bǔ)全linux下安裝nbextensions，jupyter_nbextensions_configurator。 重啟jupyter，在根目錄下，點(diǎn)擊Nbextensions標(biāo)...
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cellranger拆分BCL數(shù)據(jù)cellranger mkfastq Illumina測序下機(jī)后的數(shù)據(jù)為 原始數(shù)據(jù)（raw base call ）BCL文件，拿到BCL文件之后，第一步是使用cellrang...
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pandas修改索引數(shù)據(jù)如下： 目的是修改index的1-0到1. 1. rename 2. map 以上方法，賦值才會(huì)改變?cè)瓉淼臄?shù)據(jù)。
個(gè)人介紹
生物信息；python/R/Shell編程學(xué)習(xí)~
生信博士在讀~ wx同號(hào)～
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