發(fā)簡信
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個流程，并提供了基本的命令，用到的軟件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等，在此分享出來...
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Excalidraw：超好用的在線白板APP實驗室“日更挑戰(zhàn)”，每天為你帶來一款好用、好玩的工具軟件 今天，APP實驗室推薦給大家的是一款超級好用的在線繪圖工具，Excalidraw。 Excalidraw：在線...
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你好，我想問一下在測試rMATS時是不是使用的事他們自己的測試數(shù)據(jù)??？他們數(shù)據(jù)的readLength不是50嘛？為什么你101也能跑起來呀？不會報錯嘛？
RBP AS生信流程（ 四）rMATs
rMATs rMATs運行： 在rMATstest這個文件夾里有官網(wǎng)下載好的2x2測試文件： 用samtools查看bam文件： 可以看到第三列為1，代表1號染色體（這里是1...
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@hu巴 抱歉，原作者撤了文章我也不能再傳播啦
【CIBERSORT】超詳細，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析（初學者筆記）
【CIBERSORT】超詳細，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析全過程(初學者筆記) cibersort是目前引用次數(shù)最多的免疫細胞浸潤估計分析工具，2015年首次發(fā)表于nature me...
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求助！如果報錯說"there is no package called panc8.SeuratData"該怎么辦啊
SeuratData||你需要的單細胞數(shù)據(jù)分析實例數(shù)據(jù)合集
SeuratData是一種使用R的內(nèi)部包和數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)以Seurat對象的形式分發(fā)數(shù)據(jù)集的機制。它代表了一種方便用戶訪問Seurat中使用的數(shù)據(jù)集的方法。 我們創(chuàng)建了seur...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（三）利用clusterProfiler進行富集分析clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個R包，可以用來做各種富集分析，如GO、KEGG、DO（Disease Ontology analysis）、Reacto...
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教你畫一個掰彎的熱圖（Heatmap），展示更多的基因表達量難道，這不像孔雀開屏嗎？ 寫在前面 組學數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫，但是信息的挖掘仍任重道遠。順手的工具，可以節(jié)省使用者盡可能多的時間，或者將看起來很復雜，很難以完成的事情，變得非常簡單。...
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@鄭寶童 謝謝呀~
[R]用R執(zhí)行cibersort，根據(jù)組織的基因表達譜獲取細胞的百分比
CIBERSORT is an analytical tool developed by Newman et al. to provide an estimation of ...
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【CIBERSORT】超詳細，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析（初學者筆記）【CIBERSORT】超詳細，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析全過程(初學者筆記) cibersort是目前引用次數(shù)最多的免疫細胞浸潤估計分析工具，2015年首次發(fā)表于nature me...
