轉座子數(shù)據(jù)庫 ??上一篇《TEtranscripts：轉座子元件差異表達[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzODI1MjYyNA==&...
發(fā)簡信
IP屬地：福建
-
-
Seurat計算topN PC維度的貢獻率
?最近項目需要計算Seurat[1] (v3.1.2)進行PCA降維后選取的top20 PC對數(shù)據(jù)的解釋度，但是發(fā)現(xiàn)Seurat自帶函數(shù)計算的結果并不能直接用來計算。 Run...
-
作業(yè)管理系統(tǒng)
簡介 在超算和集群中通常要使用作業(yè)管理系統(tǒng)，關于其介紹見維基百科[https://en.wikipedia.org/wiki/Job_scheduler#Batch_queu...
-
在stringtie結果中提取count/fpkm/tpm matrix
stringtie官網(wǎng)[http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual]提供了prepDE.py文件，用...
-
bedtools shuffle -incl 參數(shù)
bedtools shuffle 參數(shù)中 -excl 和-incl參數(shù) bedtools的具體使用可以在官網(wǎng)查詢。但-excl和-incl參數(shù)可能沒有講明白 -incl參數(shù)的...
-
轉錄組分析-上下調(diào)基因條形圖
setwd("Desktop/transcriptom") library(ggplot2)kob <- read.csv("count - up and down regu...
-
【小工具】智能合并測序數(shù)據(jù)fastq的腳本
介紹： 這是一個可以自動合并數(shù)據(jù)的簡易腳本 應用場景： 有一批數(shù)據(jù)有三十幾個樣本,測序公司返回數(shù)據(jù)時由于數(shù)據(jù)量不達標，需要加測一次，部分樣本數(shù)據(jù)量還是不夠, 又加測一次才夠，...
-
Fit-hic 2 通過hic數(shù)據(jù)檢測顯著性互作安裝官網(wǎng)中提到三種安裝方法，可通過conda, pip，git clone 安裝該軟件.我們這里利用conda,非常簡單快速.1.1 conda創(chuàng)建環(huán)境 1.2 conda ...
