scWGCNA是一個(gè)生物信息學(xué)工作流程，是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork...
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單細(xì)胞加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析scWGCNA-01 -
如何科學(xué)選擇單細(xì)胞分析軟件呢？
作者：Holiday審稿：童蒙編輯：amethyst 引言 對(duì)不同技術(shù)和實(shí)驗(yàn)平臺(tái)產(chǎn)生的各種各樣的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行深入的比較，在目前看來，仍然存在著一定的難度。這篇文章主要利...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組流程一：安裝運(yùn)行cellranger及結(jié)果解讀
單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger 相信做單細(xì)胞的小伙伴對(duì)Cell Ranger這個(gè)軟件都不陌生，我們今天就來了解一下Cell Ranger的安裝和使用方法。Cell R...
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python matplotlib模塊: FuncAnimation(動(dòng)態(tài)模擬)matplotlib包下下的animation模塊的FuncAnimation方法可以稱的上matplotlib功能最強(qiáng)大的方法之一了，使用它可以創(chuàng)建很多豐富美麗的數(shù)據(jù)圖像，...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程: Integration and Label Transfer前情回顧： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教...
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【r<-開發(fā)】命名空間的使用
有4個(gè)函數(shù)可以使用三方包的功能（函數(shù)、數(shù)據(jù)等），基于它們是否加載（Load）或綁定（attach），找不到包時(shí)的反饋而有所不同。 拋出error返回 FALSELoadloa...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】SPRING算法環(huán)境部署與使用Github官網(wǎng)里的介紹: SPRING ( https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx792[https://doi.org/10...
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CytoTRACE 原理及代碼解釋CytoTRACE是一款基于單細(xì)胞計(jì)數(shù)矩陣推測(cè)細(xì)胞間活性和細(xì)胞間相對(duì)分化狀態(tài)的一款軟件，這里我們結(jié)合實(shí)際代碼例子，解釋CytoTRACE的數(shù)學(xué)原理： step 1:這一步先將...
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深入淺出讓你理解什么是LLVM什么是LLVM LLVM項(xiàng)目是模塊化、可重用的編譯器以及工具鏈技術(shù)的集合。 美國計(jì)算機(jī)協(xié)會(huì) (ACM) 將其2012 年軟件系統(tǒng)獎(jiǎng)項(xiàng)頒給了LLVM，之前曾經(jīng)獲得此獎(jiǎng)項(xiàng)的軟件和...
個(gè)人介紹
廈大本科，清華生科院博士生在讀，對(duì)表觀遺傳，計(jì)算生物學(xué)，發(fā)育生物學(xué)領(lǐng)域感興趣