群體遺傳學(xué)－分析內(nèi)容 A 遺傳多樣性 1 等位基因遺傳多樣性 2 多位點(diǎn)聯(lián)合基因型遺傳多樣性 B 群體結(jié)構(gòu)分析 1 群體差異分析（fst gst等） 2 amova 分子方差...
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群體遺傳分析內(nèi)容
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Hyphy，不亞于Paml的選擇壓力分析的優(yōu)秀軟件，使用指北
近幾年來(lái)，Hyphy的使用人數(shù)越來(lái)越來(lái)多，雖然不及paml，但這款軟件的一些優(yōu)秀特性使得它值得受到使用和關(guān)注。首先相比paml，hyphy有以下幾大優(yōu)點(diǎn)： 操作使用簡(jiǎn)單。 運(yùn)...
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win10開(kāi)啟內(nèi)置Ubuntu日常開(kāi)發(fā)中經(jīng)常windows和Linux系統(tǒng)頻繁切換，比較常用的方法是window+虛擬機(jī)的Linux。但是這樣來(lái)回切換效率較低，而且虛擬機(jī)比較吃內(nèi)存，我的8G內(nèi)存+i562...
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「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)行直系同源基因分析談?wù)摰街毕低椿蚍治龅臅r(shí)候，大部分教程都是介紹OrthoMCL，這是2003年發(fā)表的一個(gè)工具，目前的引用次數(shù)已經(jīng)達(dá)到了3000多，但這個(gè)軟件似乎在2013年之后就不在更新，...
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StringTie在注釋基因組時(shí)的注意事項(xiàng)
在利用RNA-seq注釋基因組時(shí)，有一個(gè)問(wèn)題就是，我將不同組織來(lái)源的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和參考基因組比對(duì)之后，那下一步是1）先將這三個(gè)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行合并，然后用StringTie進(jìn)行預(yù)測(cè)...
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為什么學(xué)了很多知識(shí)卻記不住？不要只記筆記，學(xué)習(xí)輸出的7種模式
導(dǎo)語(yǔ)：你以為學(xué)習(xí)的時(shí)候記了筆記就算是好好學(xué)習(xí)了？錯(cuò)！這篇文章告訴你什么是高質(zhì)量的輸出，如何才能把學(xué)到的知識(shí)記牢固。 首先呢，我想讓你思考幾個(gè)問(wèn)題： 1. 看完一本書，你是不是...
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「文獻(xiàn)」多倍體植物基因組測(cè)序組裝當(dāng)前策略
「文獻(xiàn)」多倍體植物基因組測(cè)序組裝當(dāng)前策略 文獻(xiàn)地址: Current Strategies of Polyploid Plant Genome Sequence Assemb...
