前言 單細(xì)胞的擬時序分析是利用算法模擬不同細(xì)胞之間的分化趨勢，目前已經(jīng)是一種相對常規(guī)化的分析手段。通過擬時序分析，可以模擬不同細(xì)胞之間的潛在分化聯(lián)系，因此可以起到動態(tài)預(yù)測的作...
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SCPA（三）：具有擬時序特征的通路活性評估
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monocle2 擬時間分支點(diǎn)分析結(jié)果解讀How to map cell fate to branches? 擬時間分析結(jié)果有很多重要的結(jié)果，但是這些結(jié)果如何解讀？比如下圖的分支點(diǎn)分析結(jié)果： 從圖中可以看到，行代表基...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合-1：Harmony原理介紹和官網(wǎng)教程目錄：1. 原理介紹2. 操作演示3. 關(guān)于Harmony操作是否會對差異分析產(chǎn)生影響 1. 原理介紹 官網(wǎng)：https://github.com/immunogenomic...
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CIBERSORT：反卷積推測bulk中的細(xì)胞類型五一學(xué)了一個新的分析方法-CIBERSORT，這個包其實(shí)很早就想學(xué)的，因為現(xiàn)在一般的單細(xì)胞文章的套路，很難不用到它，那么它能干什么呢？它能夠推測出bulk RNA每一個樣本中...
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【R>>MOVICS】多組學(xué)+亞型秘密武器MOVICS包整合多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，其安裝的過程太讓人心酸，大家安裝的過程慢慢體會，下面就來學(xué)習(xí)下這個由“大魚海棠”老師開發(fā)的R包吧。 1.示例數(shù)據(jù) brca.tcga.R...
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數(shù)據(jù)分析之回歸分析回歸，最初是遺傳學(xué)中的一個名詞，是由生物學(xué)家兼統(tǒng)計學(xué)家高爾頓首先提出來的。他在研究人類的身高時，發(fā)現(xiàn)高個子回歸于人口的平均身高，而矮個子則從另一個方向回歸于人口的平均身高。 ...
