更好的閱讀體驗(yàn)-->> ggplot2 (Hadley Wickham開(kāi)發(fā))是目前R語(yǔ)言數(shù)據(jù)可視化的主流。與R的基礎(chǔ)繪圖系統(tǒng)相比，基于grid繪圖系統(tǒng)的ggplot2已經(jīng)在語(yǔ)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山西
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ggpubr：快速繪制用于發(fā)表的圖形 -
轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對(duì)及可變剪切
轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對(duì)及可變剪切 STAR比對(duì)的特點(diǎn)： 速度快 準(zhǔn)確度高 3'reads soft clip genomeLoad LoadAndKeep 多個(gè)比對(duì)共享...
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SignalP 5.0：信號(hào)肽預(yù)測(cè)信號(hào)肽（signal peptides）：是引導(dǎo)新和成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈，長(zhǎng)度約5-30個(gè)氨基酸；對(duì)應(yīng)的mRNA序列，在起始密碼子后，有一段編碼疏水性氨基酸序列的...
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生信小工具專(zhuān)題：BBTools/BBMap Suite 的使用 (1)
不會(huì)編程的小白通常會(huì)煩惱怎樣去處理一些簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)，不要緊其實(shí)日常我們用到百分之80以上的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析，都已經(jīng)有人幫我們將輪子造好了，只要我們學(xué)會(huì)怎樣利用好這些工具，很多事...
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簡(jiǎn)單小需求：如何將FPKM轉(zhuǎn)換成TPM？
劉小澤寫(xiě)于19.2.21或許這還是個(gè)比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析，得到的結(jié)果可能是FPKM。但是FPKM確實(shí)存在不準(zhǔn)確性，推薦使用TPM。 read count和FPKM...
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通配符 和 正則表達(dá)式 關(guān)系1 概述 通配符和正則表達(dá)式經(jīng)常會(huì)引起混亂，本文兩者之間的區(qū)別進(jìn)行比較。 通配符用于匹配文件名，shell在做PathnameExpansion時(shí)用到的。通配符是由shell...
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從NCBI-SRA和EBI-ENA數(shù)據(jù)庫(kù)下載數(shù)據(jù)NCBI-SRA和EBI-ENA數(shù)據(jù)庫(kù) SRA數(shù)據(jù)庫(kù): Sequence Read Archive：隸屬NCBI (National Center for Biotechno...
