生物信息學(xué)專業(yè)<br>公眾號：生信學(xué)習(xí)手冊
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R可視化——拓展：個性散點圖繪制???? 在之前的推文中小編給大家展示過如何繪制散點圖，今天，小編給大家展示的內(nèi)容是對之前散點圖的一部分拓展——將散點圖中的散點換成俏皮可愛的圖案。當(dāng)然，這種圖案雖然有趣，對...
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R可視化——基于wordcloud2包繪制詞云圖???? 詞云圖 (Word Cloud) ，又名「標(biāo)簽云圖」，主要通過使每個字的大小與其出現(xiàn)頻率成正比，進(jìn)而顯示不同單詞在給定文本中的出現(xiàn)頻率，然后將所有的字詞排在一起，形...
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R可視化——基于ggplot2包繪制南丁格爾玫瑰圖南丁格爾玫瑰圖（Nightingale rose diagram）又名雞冠花圖、極坐標(biāo)區(qū)域圖，是南丁格爾在克里米亞戰(zhàn)爭期間提交的一份關(guān)于士兵死傷的報告時發(fā)明的一種圖表。南丁格...
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R可視化——基于ggbump包繪制凹凸圖（Bump chart）凹凸圖（bump chart）是折線圖的變形形式，這種圖常用于展示一組數(shù)據(jù)隨時間產(chǎn)生的排名而非絕對值的變化。下面，小編就基于ggbump包給大家展示如何繪制凹凸圖。 安裝、加...
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R可視化——基于waterfalls包繪制瀑布圖（Waterfall plot）???? 瀑布圖 (Waterfall Plot) 是由麥肯錫顧問公司所獨創(chuàng)的圖表類型，因為形似瀑布流水而稱之為瀑布圖。此種圖表采用絕對值與相對值結(jié)合的方式，適用于表達(dá)數(shù)個特...
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R可視化——議會圖（parliament diagrams）的繪制? ???今天給大家所要展示的圖形是一種柱形圖的變形圖表——議會圖（parliament diagrams）！ 安裝、加載R包 數(shù)據(jù) 使用ggparliament包自帶的數(shù)據(jù)...
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R可視化——基于beeswarm包繪制蜜蜂圖（beeswarm plot）蜜蜂圖（beeswarm plot）是一種與“抖動圖”相似的散點圖，這種圖可以直觀地展現(xiàn)每一個樣本的具體情況及整體的情況。 安裝、加載R包 數(shù)據(jù) 繪圖 1、基礎(chǔ)繪圖 2、個性...
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R可視化——圖片顏色提取及應(yīng)用（以jpg格式圖片為例）設(shè)置工作目錄、加載R包 加載圖片并提取顏色 1、圖片加載及預(yù)覽——jpg格式圖片加載主要基于imager包中的load.image()函數(shù)： 2、提取圖片顏色——主要基于RI...
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柱狀堆積圖一般用于展示群落結(jié)構(gòu)組成信息等數(shù)據(jù)
R可視化——繪圖過程中X軸及Y軸樣本展示順序的指定
????在使用R語言進(jìn)行數(shù)據(jù)可視化過程中，大家可能會遇到數(shù)據(jù)中樣本名稱順序與圖形中樣本展示順序不一致的問題，或者是我們想要讓圖形中的樣本順序按照我們指定的進(jìn)行繪制。今天，小編...
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R可視化——散點圖的繪制及其拓展數(shù)據(jù) 本文章共用到三個R內(nèi)嵌的數(shù)據(jù)集——iris、mpg、mtcars： 散點圖的繪制及其拓展 1、基礎(chǔ)散點圖繪制 2、具有相關(guān)性的散點添加擬合曲線并添加相關(guān)系數(shù)——使用到了...
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R可視化——圖形繪制過程中如何實現(xiàn)局部放大？數(shù)據(jù)及基礎(chǔ)圖形的繪制 1、數(shù)據(jù)——以R自帶數(shù)據(jù)集iris為例 2、基于ggplot2包繪制散點圖 局部放大效果的實現(xiàn) 1、加載包——主要基于ggforce包實現(xiàn)圖形的局部放大...
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R可視化——雷達(dá)圖的繪制???? 雷達(dá)圖（Radar Chart）是一種以從同一點開始的軸上表示的三個或更多個定量變量的二維圖表的形式顯示多變量數(shù)據(jù)的圖形方法。 數(shù)據(jù) 繪圖 1、安裝、加載包 2、繪...
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R可視化——矩形樹圖的繪制???? %是一種表示樹形數(shù)據(jù)的樹形關(guān)系及各個分類的占比的圖形，適合展現(xiàn)具有層級關(guān)系的數(shù)據(jù)，能夠直觀體現(xiàn)同級之間的比較。 安裝、加載所需R包 數(shù)據(jù) 繪圖 1、查看繪圖參數(shù)： ...
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R可視化——餅圖的繪制方法匯總數(shù)據(jù) 使用隨機編寫數(shù)據(jù)，包含兩列，一列為group，一列為value: 使用Pie函數(shù)繪制餅圖 添加圖例： 也可以替換扇形中的填充形式，使用線條進(jìn)行填充： ggoplot2包...
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R可視化——ggplot2包實現(xiàn)圖形分面技巧匯總???? ggplot2包中實現(xiàn)圖形分面主要通過facet_wrap()和facet_grid()兩個函數(shù)實現(xiàn)，但是兩者之間還是存在一些差別。今天，小編通過示例給大家介紹一下...
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R可視化——基于GGally包繪制平行坐標(biāo)圖???? （Parallel Coordinates chart）是一種高維數(shù)據(jù)的可視化方法，常用于一些分類問題及回歸問題中，主要用于比較某個數(shù)值在不同分組之間的變化差異或隨...
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R可視化——基于ggplot2包繪圖的模板主題樣式匯總繪制基本散點圖 ggplot2默認(rèn)主題 1、theme_gray() 2、theme_bw() 3、theme_classic() 4、theme_light() 5、the...
個人介紹
研究生一枚，主要研究方向為植物內(nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容，公眾號【科研后花園】，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享；3）繪圖技巧分享；4）科研網(wǎng)站分享。