為什么call peak的時(shí)候RYBP用的q值是0.01而其他樣本都用的0.05，這是RYBP沒(méi)有peak的原因嗎？
ChIP-seq基礎(chǔ)入門理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平，我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫(xiě)的問(wèn)題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問(wèn)題是基因在不...
理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平，我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫(xiě)的問(wèn)題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問(wèn)題是基因在不...
文獻(xiàn)：The Tomato Translational Landscape Revealed by Transcriptome Assembly and Ribosome P...
按照前人的教程，跑了跑GWAS流程，作為初學(xué)者，歡迎大家提問(wèn)，指教。 數(shù)據(jù)來(lái)源：A new regulator of seed size control in Arabido...
請(qǐng)教一下師兄，提取172個(gè)樣本之后有些位點(diǎn)出現(xiàn)的MAF=0，是不是就是說(shuō)，在大群體中該位點(diǎn)有變異而對(duì)于這個(gè)172樣本的群體而言這個(gè)位點(diǎn)沒(méi)有變異？
重復(fù)一篇文獻(xiàn)的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理文獻(xiàn)：A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a genome-wide asso...
做RNA-seq可以比較不同樣本之間基因表達(dá)水平的差異，那么如何衡量基因的表達(dá)水平呢？ 最簡(jiǎn)單的方法是，直接比較mapping到某一個(gè)基因的reads數(shù)目。但是這種做法有不足...
