劉小澤寫于19.2.21或許這還是個(gè)比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析，得到的結(jié)果可能是FPKM。但是FPKM確實(shí)存在不準(zhǔn)確性，推薦使用TPM。 read count和FPKM...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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簡(jiǎn)單小需求：如何將FPKM轉(zhuǎn)換成TPM？
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2018-09-30 如何理解survivalROC包的統(tǒng)計(jì)學(xué)原理生存分析中的ROC是怎么來的，ROC是對(duì)二分類資料的評(píng)價(jià)指標(biāo)，那對(duì)于生存資料呢？ 首先我們分析生存資料的特點(diǎn)：（1）包含有結(jié)局和時(shí)間兩個(gè)方面的信息。（2）結(jié)局資料一般為二分類...
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TCGA TOBACCO_SMOKING_HISTORY含義在UCSC Xena下載的臨床信息中有tobacco_smoking_history這列信息，從1到5，知道是跟吸煙有關(guān)但不知道什么數(shù)字含義，google查到可能的解釋 Li...
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機(jī)器學(xué)習(xí)中的樣本不平衡問題在機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)中，我們經(jīng)常會(huì)遇到這種困擾：數(shù)據(jù)不平衡問題。 數(shù)據(jù)不平衡問題主要存在于有監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)中。當(dāng)遇到不平衡數(shù)據(jù)時(shí)，以總體分類準(zhǔn)確率為學(xué)習(xí)目標(biāo)的傳統(tǒng)分類算法會(huì)過多地...
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介（2018-06-03）[轉(zhuǎn)] GEO數(shù)據(jù)庫(kù)--檢索界面及檢索結(jié)果簡(jiǎn)介 原文：http://baijiahao.baidu.com/s?id=1575064181962032&wfr=spider&...
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Bioconductor 分析芯片數(shù)據(jù)教程
這是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在這里，教程條理清晰，對(duì)我理解芯片數(shù)據(jù)分析流程幫助很大，就把它翻譯了過來。 ...
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用R分析芯片實(shí)戰(zhàn)（上）劉小澤寫于18.9.10實(shí)戰(zhàn)上從數(shù)據(jù)下載到差異基因的獲得、初步作圖實(shí)戰(zhàn)下進(jìn)行富集分析，使用數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行注釋在此感謝jimmy的limma包等教程 1 下載芯片數(shù)據(jù) 使用Fabb...
