連鎖不平衡(linkage disequilibrium,LD)是指在某一個群體中,不同座位上兩個基因同時遺傳的頻率明顯高于預(yù)期的隨機頻率現(xiàn)象。我們一般用D,D'和r2來表示...
連鎖不平衡(linkage disequilibrium,LD)是指在某一個群體中,不同座位上兩個基因同時遺傳的頻率明顯高于預(yù)期的隨機頻率現(xiàn)象。我們一般用D,D'和r2來表示...
一定要夸夸R,可真是太棒棒啦!以下操作均基于R. 首先安裝biomaRt:BiocManager::install('biomaRt') 加載:library(biomaRt...
這篇文章是對SNP位點功能注釋在線網(wǎng)站的一個總結(jié)帖。 軟件排名不分先后,優(yōu)先順序可以看推薦指數(shù)。 彩蛋在最后,請堅持看完 1、GWAS4D, 推薦指數(shù):**** 網(wǎng)址:htt...
前言 當(dāng)我們獲得一堆“感興趣”/“有意義”的SNPs之后, 怎樣知道這些SNPs所在的基因呢? 不要告訴我一個一個在pubmed查就好~ 我們需要知道Plink哪個參數(shù)可以幫...