發(fā)表期刊和時(shí)間：Science，13 October 2023Lab：Bing Ren， 實(shí)驗(yàn)室正在研究正常和癌癥細(xì)胞的基因調(diào)節(jié)機(jī)制，與路德維希研究所和加州大學(xué)合作密切。摘要...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山西
-
A comparative atlas of single-cell chromatin accessibility in the human brain -
生信 | Circos實(shí)戰(zhàn)寫(xiě)在前面 由于circos官網(wǎng)的教程太全面了，雖然好但反而感覺(jué)比較復(fù)雜，難易上手，因此我將他們精簡(jiǎn)了一下。由于官網(wǎng)的教程中包含的數(shù)據(jù)太雜了，所以我精簡(jiǎn)了數(shù)據(jù)與代碼放到了扣扣群...
-
scanpy存儲(chǔ)h5ad報(bào)錯(cuò)
總是被基礎(chǔ)的問(wèn)題折磨得非常難受，在使用常規(guī)命令adata.write('data.h5ad')時(shí)出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)： Github上面其實(shí)由類(lèi)似的問(wèn)題討論：https://github...
-
conda默認(rèn)的cache緩存文件重定向
1. 問(wèn)題 當(dāng)使用conda安裝包時(shí)，搭建輪子會(huì)默認(rèn)使用home目錄下的存儲(chǔ)，但是有時(shí)候一次性安裝的包比較多，home目錄又小得可憐就會(huì)遇到如下報(bào)錯(cuò)： 主要是which is...
-
跨物種同源基因轉(zhuǎn)換（biomaRt和homologene）2022-06-17
適用背景 當(dāng)我們進(jìn)行跨物種比較分析時(shí)會(huì)發(fā)現(xiàn)基因名對(duì)不上，或者找不到基因，這時(shí)候就需要進(jìn)行物種間的同源基因轉(zhuǎn)換。最常用的工具就是Ensembl的biomaRt，另外還查到NCB...
-
經(jīng)典圖特征工程---節(jié)點(diǎn)分析圖分析--節(jié)點(diǎn)重要度 圖節(jié)點(diǎn)重要性分析 是一種用于評(píng)估網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)重要性的方法，它可以幫助識(shí)別網(wǎng)絡(luò)中最重要的節(jié)點(diǎn)，從而更好地理解網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)和功能。以下是圖節(jié)點(diǎn)重要性分析的一些應(yīng)...
-
ggplot繪圖（氣泡圖）（一）你永遠(yuǎn)不知道你的小伙伴會(huì)有什么奇奇怪怪的要求，而這些要求能把作為一個(gè)菜鳥(niǎo)的你折騰得半死（/ o \）~~~~這篇文章就是Poesie無(wú)數(shù)次嘔血后的干貨總結(jié)，給自己留條后路（誰(shuí)...
-
Linux expect 實(shí)現(xiàn)自動(dòng)人機(jī)交互 | 跨計(jì)算機(jī)scp/rsync進(jìn)行文件傳輸，避免用戶(hù)密碼重復(fù)輸入
1.背景簡(jiǎn)介 shell腳本在處理自動(dòng)循環(huán)或大的任務(wù)方面可節(jié)省大量的時(shí)間，通過(guò)創(chuàng)建一個(gè)處理任務(wù)的命令清單，使用變量、條件、算術(shù)和循環(huán)等方法快速創(chuàng)建腳本以完成相應(yīng)工作，這比在命...
-
ggplot-geom_point 聚類(lèi)散點(diǎn)圖添加簇標(biāo)簽本篇分享在ggplot的散點(diǎn)聚類(lèi)圖中，為每個(gè)類(lèi)群添加標(biāo)簽Label的方法，方法通過(guò)kmeans方法計(jì)算每個(gè)簇的中心，給每個(gè)簇的中心點(diǎn)添加Class_label實(shí)現(xiàn)每個(gè)簇的標(biāo)簽...
