要有自己的筆記,不能就這樣把PPT放上來
四、Linux之shell腳本編程1.Linux系統(tǒng)環(huán)境 2.變量 3.結(jié)構(gòu)化語句 (1)if語句 (2)while語句 參數(shù)擴(kuò)展3.2.9 4.Shell腳本編程 任務(wù)提交
我覺得你的id應(yīng)該改為“佳期如夢(mèng)你如是”
十年記【2010-2020】:櫛風(fēng)沐雨,春華秋實(shí)--致我的少女時(shí)代 以前做過一...
這是舊版本的了,新版本conda安裝后不再這這樣
linux安裝或卸載minicondaConda 是一個(gè)開源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng),用于安裝多個(gè)版本的軟件包及其依賴關(guān)系,并在它們之間輕松切換。 1.安裝conda 瀏覽器搜索 miniconda 清華 ...
對(duì)bed文件有些疑問,對(duì)于外顯子測序,真的使用這個(gè)文件嗎
8 比對(duì)及找變異步驟的質(zhì)控使用qualimap對(duì)wes的比對(duì)bam人家總結(jié)測序深度和覆蓋度 1 比對(duì)的各個(gè)階段的bam進(jìn)行質(zhì)控 可以把中間生成的.bam文件刪除,就是帶marked的bam文件 安裝b...
@NICE_AGIS 如果你測試OK,那就用自己的方法
samtools的安裝和使用--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具合集。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
直接刪除這一行就好
關(guān)于外顯子坐標(biāo)文件的一個(gè)問題今天在跑gatk call variant的時(shí)候,報(bào)了這樣的一個(gè)錯(cuò)誤 報(bào)錯(cuò)信息說:坐標(biāo)文件中有一個(gè)位置的終止坐標(biāo)69716217,而起始坐標(biāo)是69716218,也就是說終止坐...
要不要出個(gè)工具合集。。。雖然網(wǎng)站也能用,但是學(xué)了生信就只想用R或Linux了
SNP功能注釋網(wǎng)站合集這篇文章是對(duì)SNP位點(diǎn)功能注釋在線網(wǎng)站的一個(gè)總結(jié)帖。 軟件排名不分先后,優(yōu)先順序可以看推薦指數(shù)。 彩蛋在最后,請(qǐng)堅(jiān)持看完 1、GWAS4D, 推薦指數(shù):**** 網(wǎng)址:htt...
是在mac的家目錄里面.ssh添加多一個(gè)config 然后寫入這下面幾行行 然后回車,新起一行,按一下 Ctrl C 結(jié)束,最后重新登錄服務(wù)器即可
非常感謝你的反饋,我會(huì)仔細(xì)檢查一遍,更新后再發(fā)布
用picard制作外顯子坐標(biāo)文件--------------- Nickier 2018-12-07 --------------- 第一次用picard,不知道怎么用,先用conda安裝了一個(gè) 找到需要的...
上游分析結(jié)合數(shù)據(jù)好好理解一下,每一步都做了什么,數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)意義又是什么
RNA-seq實(shí)戰(zhàn)分析流程一、下載測序數(shù)據(jù) ①SRA數(shù)據(jù)庫[存儲(chǔ)二代測序的原始數(shù)據(jù)]②在進(jìn)行上游分析時(shí),數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換過程概述如下:sra↓FASTQ↓bam↓counts③質(zhì)控處理的相關(guān)軟件:? fa...
@魚嘯九天 謝謝,希望能幫到你
一文理解環(huán)境變量一文理解環(huán)境變量 對(duì)于Linux初學(xué)者來說,環(huán)境變量是個(gè)很陌生的名詞,很多人不能理解它是到底是什么,可以用來干嘛。其實(shí),環(huán)境變量,在windows中也有,只是我們平時(shí)不怎么直...