標(biāo)題： Single-cell RNA landscape of intratumoral heterogeneity and immunosuppressive micro...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山西
-
文獻(xiàn)復(fù)現(xiàn)01（GSE152048）：01-數(shù)據(jù)下載 -
2024-09-26 服務(wù)器上安裝Seurat
Seurat 4.？升級(jí)Seurat5報(bào)錯(cuò) lazy loading failed for package 'Seurat' 報(bào)錯(cuò) lazy loading failed f...
-
【2024-01-05】用python解決小學(xué)幾何題老婆發(fā)了道題過(guò)來(lái)，想解釋的話(huà)，畫(huà)圖是最明顯的吧，就用python的turtle模塊試試咯。 效果還不錯(cuò)，就是用三角函數(shù)算邊長(zhǎng)半徑花了點(diǎn)時(shí)間。 把問(wèn)題丟給了chatGPT 跟著...
-
-
淺淺的學(xué)習(xí)歷程<br>生信新手，打工人，搬運(yùn)工。<br>像王子文一樣財(cái)務(wù)自由，才可實(shí)現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致，才可實(shí)現(xiàn)職業(yè)自由
-
分享各種各樣的科研日常。
-
【施工中】常用數(shù)據(jù)庫(kù)下載參考基因組及注釋文件參考：Jimmy老師博客：基因組各種版本對(duì)應(yīng)關(guān)系目前常用的人類(lèi)參考基因組是GRCh37和GRCh38，在三大常用數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)應(yīng)關(guān)系如下： NCBIUCSCENSEMBLGRCh3...
-
第2周：RNA-seq數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)踐原文來(lái)源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
-
周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹(shù)。生信技能樹(shù)核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
-
【不定期更新】Bedtools大全--42個(gè)子命令介紹參考鏈接： 用法大全: 官方說(shuō)明：https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/overview.htmlBedtool...
-
2020-05-08 復(fù)現(xiàn)GSE137675 RNA-Seq結(jié)果(2)：下游分析將上游分析最后得到的counts.txt讀入到R中 讀入作者上傳的表達(dá)矩陣GSE137675_Reads_count_featureCounts.xlsx，并跟自己處理的結(jié)果...
-
2020-05-08 復(fù)現(xiàn)GSE137675 RNA-Seq結(jié)果(1)：上游分析創(chuàng)建項(xiàng)目 下載原始FastQ數(shù)據(jù) 1.1 使用循環(huán)創(chuàng)建下載地址文件 1.2 編寫(xiě)批量下載腳本aspera.sh 1.3 運(yùn)行腳本aspera.sh批量下載FastQ文件 對(duì)原...
-
單樣本基因集富集分析 --- ssGSEA1. 概述 單樣本基因集富集分析（single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA），是GSEA方法的擴(kuò)展，主要是針對(duì)單個(gè)...
-
RNA-seq 數(shù)據(jù)分析最佳實(shí)戰(zhàn)（綜述）知識(shí)的學(xué)習(xí)沒(méi)有一蹴而就，沒(méi)有捷近，扎實(shí)的學(xué)習(xí)是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的綜述，全面而詳細(xì)！深度好文，可用來(lái)反復(fù)閱讀。初學(xué)者用于把握RNA-seq真?zhèn)€流程及各個(gè)...
