了解過vcf文件的格式之后，對親本純合且差異的位點進行過濾就變得簡單多了。如果格式規(guī)范的話一行awk命令其實就能解決。這里為了提高腳本的適用范圍，所以寫的稍微麻煩了些。 腳本...
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vcf文件過濾親本純合且差異位點
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3.2 GWAS：最佳線性無偏估計量——BLUE值計算（多年單點有重復）
GWAS中使用均值、BLUP值還是BLUE值，鄧飛老師有兩篇帖子進行了介紹，鏈接如下，根據(jù)我的數(shù)據(jù)，我選擇了BLUE值。在這里提醒大家，不要一上來就忽略所有warning，很...
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基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)BSA作為基因組學中基因挖掘的三板斧之一，最大優(yōu)點是高效、經(jīng)濟、簡便。通過選擇雙親群體分離后代中具有極端表型的個體進行混樣，然后比較不同極端混樣池之間的多態(tài)性并結(jié)合表型進行目...
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真核生物的轉(zhuǎn)錄起始（2）課件來源：7.3.2 真核生物的轉(zhuǎn)錄過程（2）_嗶哩嗶哩_bilibili[https://www.bilibili.com/video/BV1h741157zC?p=84]...
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站內(nèi)、外較好的GWAS教程整理
開門見山：GWAS 總體流程理解版 - 簡書[http://m.itdecent.cn/p/c0a032a8e7d5]全基因組重測序基礎(chǔ)及高級分析知識匯總 - 知乎[h...
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1.GWAS：原理與目的全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-Wide Association Study， GWAS）是以連鎖不平衡（LD）為基礎(chǔ)，利用全基因組范圍內(nèi)群體中高密度的分子標記，鑒定與復雜性...
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ggplot2中facet_wrap( )的高階用法介紹ggplot2中facet_wrap( )函數(shù)中l(wèi)abeller 參數(shù)的用法 labeller參數(shù)，可以使用它來處理太長的facet標簽 同時顯示變量名稱與因子值 顯示因...
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一文讀懂比較基因組學
隨著基因組測序爆炸性增長，比較基因組學已逐漸成為每個物種尤其是首次被破譯基因組的物種的必備研究內(nèi)容之一。那么什么是比較基因組學呢？比較基因組學是通過對系統(tǒng)發(fā)育中的代表性物種之...
