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轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)階這是我聽孟浩巍知乎LiveB站鯪魚不會(huì)飛視頻（轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)階課程）里的筆記哦~ 本次知乎Live解決的問題： 轉(zhuǎn)錄組的建庫與質(zhì)量控制 人類基因組與轉(zhuǎn)錄組組成 轉(zhuǎn)錄組的2種建庫...
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學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
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四. 基因組數(shù)據(jù)可視化(BWA, Minimap2, samtools and IGV)一. 簡介 在基因組數(shù)據(jù)分析過程中，我們可以將fastq，fasta，ONT等不同格式的數(shù)據(jù)mapping到參考基因組上，然后通過IGV進(jìn)行可視化，結(jié)合GFF3文件手工對(duì)感興...
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hisat2比對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
目前hisat2是最流行的轉(zhuǎn)錄組比對(duì)軟件，其比對(duì)速度快，且準(zhǔn)確度較高。具體使用方法如下：用到的軟件版本為hisat2-2.2.1，samtools-1.6 1. 構(gòu)建hisa...
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
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RNAseq常規(guī)流程轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個(gè)基礎(chǔ)和常見的分析流程，一般從下機(jī)數(shù)據(jù)開始，經(jīng)過一系列的質(zhì)控，基因組比對(duì)，差異分析等過程得到實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組（或者腫瘤中的轉(zhuǎn)移組和原癌組）中差異表達(dá)的基...
