今天把官網(wǎng)流程全部看了一遍按照這樣操作了，看了一下數(shù)據(jù)正在下載，明天看一下有沒有報(bào)錯(cuò)產(chǎn)生，不知道會(huì)有啥問題等待解決。 Source：https://www.ncbi.nlm....
發(fā)簡(jiǎn)信
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2020-07-21 下載dbgap數(shù)據(jù) -
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在R語言中如何將ENSEMBL ID轉(zhuǎn)換成Gene ID或者Symbolrm(list=ls())my_data <- read.csv("expr_counts.csv")library('tidyr')library('rtracklayer...
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差異表達(dá)3｜MaGeck
MaGeck MaGeck是對(duì)CRISPR screen結(jié)果進(jìn)行篩選的軟件，差異表達(dá)的對(duì)象是sgRNA，再對(duì)不同sgRNA的結(jié)果進(jìn)行整合，得到差異基因。 1. median-...
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eQTL就那樣～（1）前言 我還未想到這個(gè)專題叫什么...... 暫定“XXX就那樣”？ 我們先來個(gè)斗雞眼，看著一下中間的QT。 1.什么是數(shù)量性狀？（quantitative trait，QT）...
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2019-02-23 QTL（轉(zhuǎn)自知乎）作者：Philip Yang 鏈接：https://www.zhihu.com/question/27695566/answer/40741777 來源：知乎 著作權(quán)歸作者所...
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Dapars2 分析可變多聚腺苷酸化（APA 3’UTR）與腫瘤
越來越懶了，不想寫記錄呀！算了，強(qiáng)迫自己一把！ 水平有限，若有錯(cuò)誤，懇請(qǐng)指出！ 信使RNA ( messenger RNA, mRNA)加工過程中的精細(xì)調(diào)控對(duì)基因的表達(dá)具有重...
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DaPars——APA分析3’UTR
Backgroud APA（alternative polyadenylation）在大多數(shù)人類基因的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中發(fā)揮著重要作用。通過使用不同的多聚腺苷酸化(poly(A))...
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比對(duì)軟件STAR的使用
在之前的學(xué)習(xí)和練習(xí)里，比對(duì)這一步我使用過bowtie2（DNA比對(duì)）和hisat2（RNA-seq比對(duì)），現(xiàn)在學(xué)習(xí)另一個(gè)很火的軟件：STAR。STAR能夠發(fā)現(xiàn)非典型拼接和嵌合...
