2024年3月1日更新 推薦直接用最近的新軟件PanDepth[https://github.com/HuiyangYu/PanDepth]，C語言寫的，速度很快。 以下為舊...
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二代測序通過bam文件統(tǒng)計深度和覆蓋度 -
「群體遺傳學(xué)實戰(zhàn)」第三課: 如何對SNP位點進行過濾
往期教程 「群體遺傳學(xué)實戰(zhàn)」第一課: 對SNP位點進行注釋 「群體遺傳學(xué)實戰(zhàn)」第二課: 畫出和文章幾乎一樣的PCA圖 SNP位點過濾 SNP過濾有兩種情況，一種是僅根據(jù)位點質(zhì)...
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跟著Cell學(xué)作圖：R語言ggplot2作圖展示差異表達的基因一組對照加處理這種實驗的差異表達分析結(jié)果通常是用火山圖來展示，如果是很多組實驗的話如何展示，這種情況我之前還沒有遇到過。公眾號后臺有讀者留言問到了如下的圖 這個圖來自于論文A...
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R語言之tidyverse包安裝瀏覽了各大網(wǎng)站關(guān)于tidyverse包的安裝，初步安裝成功，教程分享如下，如有不正確的地方還請多多指教 第一步：下載tidyverse包，鏈接：https://cran.r-...
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2020-12-17水稻、小麥GO富集分析RNAseq常規(guī)做法是先篩選出差異表達基因，然后針對篩選出來的差異基因做GO富集分析。 1.水稻、小麥GO信息提取 在進行GO富集分析前首先要確定在你所使用的GO富集分析軟件...
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Chip-seq學(xué)習(xí)記錄關(guān)于概念問題，很重要 第1篇：ATAC-seq的背景介紹以及與ChIP-Seq的異同https://mp.weixin.qq.com/s/gLcNZkzzQI4AvZs-0D...
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使用clusterProfiler包對非模式生物進行GO和KEGG的富集分析
clusterProfiler包是Y叔開發(fā)的一個強大的能進行多種功能富集的R包，對于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
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使用Atom的Snippet加速編碼
我們經(jīng)常需要對二維數(shù)組進行迭代，比如這樣： 過上一段時間，你又要寫這么一段代碼： 如果你是程序員，那么你理應(yīng)厭煩：又一次重復(fù)得輸入for,[],{}……而且一個不小心，還很容...
