作者，Evil Genius 今天我們需要梳理一個分析點：目標(biāo)細(xì)胞的鄰域。 無論對于低精度還是高精度，鄰域分析都是核心和重點，但是想要分析到這個地方，前面有很多工作要做。 對...
發(fā)簡信
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課前準(zhǔn)備--目標(biāo)細(xì)胞的鄰域分析 -
CosMx文獻分享--結(jié)直腸癌中KRAS抑制劑并發(fā)性遺傳與非遺傳耐藥機制作者，Evil Genius 大家不要以為基礎(chǔ)分析很簡單，大家先看下面 技術(shù)平臺樣本類型推薦切片厚度XeniumFFPE (石蠟切片)5 μmFresh Frozen (新鮮...
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課前準(zhǔn)備--高精度空轉(zhuǎn)識別與疾病相關(guān)細(xì)胞-細(xì)胞相互作用作者，Evil Genius 技術(shù)的發(fā)展總是很快，馬上Atera就要出了，大家敢做第一批吃螃蟹的人么？ 今天我們要更新腳本，關(guān)于高精度分析通訊的策略問題。 之前的分享，低精度...
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分子對接--3維構(gòu)象定量關(guān)系（3D-QSAR）作者，Evil Genius 5月最后一天了，我們來完成分子對接的最后一塊拼圖，3維構(gòu)象定量關(guān)系。 3D-QSAR核心目的是研究分子的三維結(jié)構(gòu)與其生物活性之間的定量關(guān)系，從而...
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頂刊分享（visium HD）--利用CRISPR篩選測序揭示空間分辨的功能基因組學(xué)作者，Evil Genius 到這一篇，我所搜集的關(guān)于visium HD實驗類文章已經(jīng)達到50篇了，大家做了HD的要加油趕緊發(fā)文章了。 今天我們分享文獻，文章的核心目的：將基...
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分子動力學(xué)--分析結(jié)果的詳細(xì)解讀作者，Evil Genius 這一篇我們來詳細(xì)解讀分子動力學(xué)最后的分析結(jié)果。 首先第一個：RMSD--用于量化分子結(jié)構(gòu)的變化程度或差異大小。 RMSD的定義：均方根偏差計算的...
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課前準(zhǔn)備--低精度（visium）百分比矩陣矯正與細(xì)胞niche分析作者，Evil Genius 針對低精度的visium數(shù)據(jù)，大家分析細(xì)胞niche的結(jié)果還好么？ 隨著分析的深入，大家還可以自我設(shè)置niche參數(shù)人為定義么？ 對不起，大概率...
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計算機輔助藥物設(shè)計的流程梳理作者，Evil Genius 整理了分子對接和分子動力學(xué)，我們來梳理一下計算機輔助藥物設(shè)計的流程。 小分子藥物設(shè)計是一個快速發(fā)展的領(lǐng)域，它具有革新新藥物開發(fā)的潛力。隨著結(jié)構(gòu)生...
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visium HD & 分子動力學(xué)--內(nèi)皮SMAD1-MCAM軸通過LAMB1-ITGB1信號通路促進舒尼替尼耐藥及透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌的進展作者，Evil Genius 大家能接受自己是同學(xué)中混得最差的么？大家愿意接受自己的人生算失敗么？ 命運這種事，真的讓人難以捉摸，起起落落。 山西長治市沁源縣5月22號煤礦瓦...