最近要玩一些新包，需要在4.0以上版本的R 里面跑，需要source安裝包“Matrix”，各種報(bào)錯(cuò)。 make: *** [Matrix.so] Error 1 ld: w...
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Mac （11.0.1 ）升級 R 4.0.3 遇坑
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QNAP WEBDAV 權(quán)限問題解決
vi /etc/config/apache/extra/apache-dav.conf定位到你共享的文件名如我要共享 “soft" "Print“ 將Options Foll...
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不能用載體連接這一段序列，應(yīng)該使用dcas9激活或者抑制。
如何通過CHIP-seq分析鑒別基因啟動(dòng)子和增強(qiáng)子
一、表觀遺傳學(xué)的組蛋白修飾 染色體一個(gè)核小體由兩個(gè)H2A，兩個(gè)H2B，兩個(gè)H3，兩個(gè)H4組成的組蛋白八聚體和147bp纏繞在外面的DNA組成。組蛋白有很多修飾形式，包括組蛋白...
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沒.fa文件做什么都做不了啊。
如何通過CHIP-seq分析鑒別基因啟動(dòng)子和增強(qiáng)子
一、表觀遺傳學(xué)的組蛋白修飾 染色體一個(gè)核小體由兩個(gè)H2A，兩個(gè)H2B，兩個(gè)H3，兩個(gè)H4組成的組蛋白八聚體和147bp纏繞在外面的DNA組成。組蛋白有很多修飾形式，包括組蛋白...
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@是鳴 你要找一下自己的aspera裝在哪里。
在Mac 和windows上用 Aspera Connect下載NCBI Sra數(shù)據(jù)
做生信分析在NCBI上下數(shù)據(jù)是第一步，不一定非要用linux下，裝好sratools和Aspera Connect和都沒問題。在這里NCBI SRA Toolkit找屬于你版...
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在Mac 和windows上用 Aspera Connect下載NCBI Sra數(shù)據(jù)
做生信分析在NCBI上下數(shù)據(jù)是第一步，不一定非要用linux下，裝好sratools和Aspera Connect和都沒問題。在這里NCBI SRA Toolkit找屬于你版...
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DNA甲基化分析----------甲基化比對軟件專題（Bismark）??我們在上個(gè)筆記中介紹了一些關(guān)于DNA甲基化的基本概念。那么如何去判斷這個(gè)序列里面甲基化的信息呢？今天我們就來就這個(gè)話題好好聊一聊~--------------------...
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哪種遺傳變異決定了組蛋白標(biāo)記？
人類基因組中豐富的遺傳變異不是在蛋白質(zhì)編碼基因中發(fā)現(xiàn)的，而是在非蛋白質(zhì)編碼區(qū)域內(nèi)發(fā)現(xiàn)的。鑒于只有1％的基因組編碼蛋白質(zhì)，這并不奇怪。直到最近，確定遺傳變異對性狀變異和疾病的影...
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hic分析之分步工作原理參考之前的文章 hic分析之 hic-pro 介紹與安裝 分步工作原理： 先看test文件 再看看opt文件 工作原理介紹： 1.Reads Mapping 將fastq文...
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hic分析之 hic-pro 介紹與安裝
一、hic-pro是什么，參考網(wǎng)頁： [GitHub] https://github.com/nservant/HiC-Pro[DOCUMENTATION] http://n...
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已知矩陣，制作RNA_motif的logo
這是一個(gè)很簡單的訴求，可以用的方法有很多，今天談一下MotifStack.介紹鏈接：MotifStack先弄清楚，motif的矩陣格式。 大家應(yīng)該看明白了，motif的矩陣格...
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U17 snoRNA調(diào)節(jié)細(xì)胞膽固醇的轉(zhuǎn)運(yùn)
引言U17 snoRNA是第一個(gè)涉及膽固醇穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)的H/ACA snoRNA。已知H/ACA snoRNA靶向rRNA，tRNA和小核RNA（snRNA）以通過其遠(yuǎn)端環(huán)結(jié)合靶...
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snoRNA的新功能—參與調(diào)控mRNA 3’末端的加工
引言mRNA 3’末端加工是基因表達(dá)中必不可少的一步。經(jīng)典的真核生物前體mRNA 3’加工是在由數(shù)十種反式作用蛋白組成的大分子機(jī)器內(nèi)進(jìn)行的。然而，RNA在這個(gè)過程中是否起作用...
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CircRNA的ceRNA機(jī)制研究文獻(xiàn)解讀
文獻(xiàn)摘要:越來越多的證據(jù)表明環(huán)狀RNAs（circRNA）是在腫瘤發(fā)生中起重要作用。然而，circRNA在三陰性乳腺癌（TNBC）中的功能在很大程度上是未知的。作者使用cir...
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細(xì)胞衰老克星-CircPVT1
Identification of senescence-associated circular RNAs(SAC-RNAs) reveals senescence supp...
