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  • 自然辯證法考試四道題的資料

    古希臘的自然觀泰勒斯:水是世界的本原。 即萬物的開端、開始和起源是水;水是生命的本原,滲透在萬事萬物之中,使得宇宙成為有機體。 畢達哥拉斯:把數(shù)當作世界的本原,主張“萬物皆數(shù)...

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    解決 Linux 和 Windows 雙啟動帶來的時間同步問題

    編譯自:http://www.theitstuff.com/how-to-sync-time-between-linux-and-windows-dual-boot-2作者:...

  • Gromacs參數(shù)文件md.mdp翻譯詳解

    AspirinCode:點擊打開鏈接 官網:點擊打開鏈接 李老師博客:點擊打開鏈接 蛋白質配體復合物模擬md運行過程中需要用到輸入文件md.mdp,現(xiàn)對里面的各種編輯項目做簡...

  • 轉-層析

    文 南京大學 楊榮武教授 層析在蛋白質分離純化中是不可替代的一種方法,早在1903年,層析法就被俄國植物學家Mikhail Tswett 用來分離植物色素,因此又稱為色譜。所...

  • 計算PCA和FEL

    平衡軌跡all.trr: 25000-50000 50-100ns不要隔幀取 先用 選擇蛋白質的alpha碳,和核酸的磷。把PCA用到的index得到,保存為PCA.ind...

  • How to find my TeamViewer ID on SSH?

    Set your password first: And the run: It will show you the TeamViewer ID.

  • 轉-Teamviewer ubuntu 提示 TeamViewer Daemon is not running

    Ubunut 12.04下面安裝了Teamviewer,剛安裝完啟動是沒有問題的,每次重啟打開就會提示: "TeamViewer Daemon is not running ...

  • Linux 小知識翻譯 - 「SCP和SFTP」

    wang_yb 這次想說說「SCP和SFTP」。 不管SCP還是SFTP,都是SSH的功能之一。都是使用SSH協(xié)議來傳輸文件的。 不用說文件內容,就是登錄時的用戶信息都是經過...

  • Cas9蛋白的兩個結構域的作用

    Cas9蛋白包含的HNH核酸酶結構域負責切割外源DNA與間隔序列互補的鏈,而RuvC結構域負責切割外源DNA的另一條鏈。而且Cas9蛋白可以方便地將核酸酶改造為切口酶(nic...

  • 用NAMD軌跡文件算mmpbsa

    為安裝PyTopol做準備,先安裝pip要先安裝python,以及easy_install,再安裝pip 安裝PyTopolpip install pytopol 安裝完Py...

  • error: 'cout' was not declared in this scope

    Linux下C++編譯出錯原因解析 程序: 編譯出錯:$ g++ s.cpp -o s.outs.cpp: In function 'int main(int, char**...

  • 分子模擬DCD文件去水

    去掉水的步驟: 在VMD Tk consle中先用 把蛋白質和DNA的index得到,保存為protein_DNA.ind 然后在終端中用./catdcd -o XXX-no...

  • 不同的同源

    同源(Homologs): 來源于共同祖先的相似的序列為同源序列。相似序列并不一定是同源序列。 直系同源(Orthologs): 來自于不同物種的,由垂直家系(物種形成)進化...

  • 查看RMSD

    (protein or nucleic) and backbone

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    BLAST分類

    BLASTn:用核酸序列搜索核酸序列數(shù)據(jù)庫 BLASTx:將核酸序列按6條鏈翻譯成蛋白質序列后搜索蛋白質序列數(shù)據(jù)庫 tBLASTn:用蛋白質序列搜索核酸序列數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)庫中的...

  • 轉-NAMD中原子速度過快的問題

    能量最小化不夠,增加minimize的步數(shù)。能量最小化3000步一般是足夠的,不必把能量最小化至收斂的情況,那樣意義不大。消除一些明顯不合理的構象就足矣。 能量最小化已經充分...

  • RMSD和RMSF

    RMSD,Root Mean Square Deviation;RMSF,Root Mean Square Fluctuation。一個是偏移,一個是漲落。二者都是對位移的平...

  • 轉-VMD中的向量操作

    set vec1 { 1 2 3}set vec2 {9 8 7} 以上是兩個要操作的向量加法:vecadd $vec1 $vec2 #輸出結果為 10 10 10減法:ve...

  • C4.5的增益率準則

    需要注意的是,增益率準則對可取值數(shù)目較少的屬性有所偏好,因此,C4.5算法并不是直接選擇增益率最大的候選劃分屬性,而是使用了一個啟發(fā)式: 先從候選劃分屬性中找出信息增益高于平...

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