寫在前面 最近可能是不少人要趕畢業(yè)論文,于是找上了 TBtools,并急急忙忙希望解決自己的問題。于是,他們總是會在群里 @我 或者 @管理員。事實上,這是一個違背群約定的事...
寫在前面 最近可能是不少人要趕畢業(yè)論文,于是找上了 TBtools,并急急忙忙希望解決自己的問題。于是,他們總是會在群里 @我 或者 @管理員。事實上,這是一個違背群約定的事...
@斬毛毛 多物種就要選前景枝和背景枝吧,打個比方,1物種和2物種是聚在一起的,3物種是聚在大枝的,那結(jié)果里也會有1物種和3物種的基因?qū)Φ慕Y(jié)果嗎
paml計算 KaKs值此前介紹利用Kaks_calculator計算ka/ks 值,本次對paml 進(jìn)行計算kaks做一簡單介紹。 軟件安裝 PAML 可實現(xiàn)系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建,祖先序列估計,進(jìn)化模...
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用,有錯誤請指出,我立刻改正! 官方說明:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279684/#appendic...
@GaGaLab 是我搞錯了,放到Rstudio里面運行,就有結(jié)果生成了。謝謝回信。
RSEM的TPM,FPKM,COUNT數(shù)據(jù)整合RSEM的數(shù)據(jù)整合只能整合count內(nèi)容所以簡單寫了個函數(shù)整合RSEM的TPM,FPKM,COUNT
@GaGaLab 我生成的是樣本名稱,大佬是這樣的嗎
RSEM的TPM,FPKM,COUNT數(shù)據(jù)整合RSEM的數(shù)據(jù)整合只能整合count內(nèi)容所以簡單寫了個函數(shù)整合RSEM的TPM,FPKM,COUNT
「生物信息」概念被提出已有許多年,可以說比我年齡大了許多。但到底是什么,不同人有不同定義。尤其自高通量測序出現(xiàn),對于生物信息來說,有一大波變化。而我時常與相似背景的朋友提及,...
今天骨科一位學(xué)生問我他在做富集分析的時候,得到的文字太長了,如何讓文字分開的問題,其實富集分析經(jīng)常會得到一些結(jié)果的標(biāo)題很長很長,不管是barplot還是dotplot都會出現(xiàn)...
@tttxd 那就一個一個來吧,速度應(yīng)該也挺快的吧,我也只試過一個物種的
尋找R gene三種方法之RGAugury特別感謝賣萌哥[http://m.itdecent.cn/u/77fc519c6fa2]對于R gene的資源分享和指導(dǎo)幫助 參考文獻(xiàn):RGAugury: a pipe...
寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴,可以通過以下幾段內(nèi)容,了解一下,我為什么要費勁巴拉畫出這樣一張圖。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
安裝時間:2021.1.26常用次生代謝產(chǎn)物預(yù)測軟件:antiSMASH[https://antismash.secondarymetabolites.org/#!/star...
@32047e0c8ad2 具體從什么版本變更到怎么版本,分享一下吧
尋找R gene三種方法之RGAugury特別感謝賣萌哥[http://m.itdecent.cn/u/77fc519c6fa2]對于R gene的資源分享和指導(dǎo)幫助 參考文獻(xiàn):RGAugury: a pipe...
想嘗試這個數(shù)據(jù)庫,注冊了帳號好像需要激活才能使用
【數(shù)據(jù)庫】RxnFinder由胡春楠老師團(tuán)隊開發(fā)的生物合成反應(yīng)數(shù)據(jù)庫(RxnFinder),這個數(shù)據(jù)庫由專門的公司團(tuán)隊在維護(hù)更新。下面是官網(wǎng)介紹: 微生物細(xì)胞工廠在生產(chǎn)大宗化學(xué)品、天然產(chǎn)品、生物燃料等方...
@32047e0c8ad2 評論好像不能放圖片。如果沒報錯,按理是不會為0的
尋找R gene三種方法之RGAugury特別感謝賣萌哥[http://m.itdecent.cn/u/77fc519c6fa2]對于R gene的資源分享和指導(dǎo)幫助 參考文獻(xiàn):RGAugury: a pipe...
寫在前面 最近給研究生師弟師妹講一門名為「園藝植物生物信息學(xué)實踐」的選修課... 計劃10~30人,估摸系統(tǒng)出了問題,最終選了 44 人。盡管我盡可能勸退,但仍然有 68+ ...
??還在為批量下文獻(xiàn)而發(fā)愁嗎,來tbtools
插件 | 給一堆「doi」,出一堆「論文.pdf」寫在前面 最近給研究生師弟師妹講一門名為「園藝植物生物信息學(xué)實踐」的選修課... 計劃10~30人,估摸系統(tǒng)出了問題,最終選了 44 人。盡管我盡可能勸退,但仍然有 68+ ...
IGV提供了BLAT,用于進(jìn)行序列搜索,但可惜我一直用不上,因為它默認(rèn)是調(diào)用了UCSC的CGI工具,將我們的輸入序列發(fā)送到https://genome.ucsc.edu/cg...
今天剛搜過,今天就出現(xiàn)了??
神器!| 加速訪問 github ,加速你的科研寫在前面 目前,github 應(yīng)是生信軟件擺放的主流倉庫。比如我們熟悉的TBtools, Seqkit,IGV等等。當(dāng)然,甚至很多時候,我們會發(fā)現(xiàn)一些高水平的分析類文章直接講...