一般來說，阿里云ECS服務(wù)器的Linux系統(tǒng)默認是沒有圖形界面的，那么如何才能安裝并遠程連接Linux服務(wù)器上的圖形界面呢？ 1. 登錄的Lin...
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CentOS上如何安裝和卸載X Window System
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R繪制玫瑰圖，我有玫瑰，你要代碼么？更新什么的，都是浮云 先直接上圖 其實就是x軸極化的柱狀圖，bar長和顏色也是連續(xù)變量，label color表示基因類型是離散變量 上數(shù)據(jù)： ...
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KnockTF:轉(zhuǎn)錄因子敲出/低的表達譜整合性數(shù)據(jù)庫今天介紹一個轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的數(shù)據(jù)庫KnockTF，它提供了大量將轉(zhuǎn)錄因子（TF）敲出/低的人類表達譜數(shù)據(jù)集，以及轉(zhuǎn)錄因子的其他注釋信息，包括靶基因...
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基于集成網(wǎng)絡(luò)的細胞特征文庫LINCS介紹LINCS(The Library of Integrated Network-Based Cellular Signatures)是NIH旗下...
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使用MuSiC分析bulk RNA-seq中的細胞組分我們之前已經(jīng)介紹過如何《使用xcell根據(jù)表達譜推斷樣本組成細胞的類型》，具體思路就是根據(jù)已知細胞系的表達譜，計算每種類型細胞的特征基因表達，然...
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RNA-seq 表達數(shù)據(jù)清洗CPM>1
RNA-seq的數(shù)據(jù)往往需要剔除表達較低的基因，一般認為在半數(shù)以上樣本中基因表達需要CPM>1，對于coding gene來說可以更為嚴格點，如...
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R語言獲取四分位分組\高低表達分組
如題 自由發(fā)揮自由擴散
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deepTools 使用指南deepTools 是一套基于python開發(fā)的工具，適用于有效處理分析高通量測序數(shù)據(jù)，可用于ChIP-seq, RNA-seq 或 MNase...
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簡單的基因ID轉(zhuǎn)換
基因ID轉(zhuǎn)換有很多方法，對高手如飲水吃飯，對新手來說卻是很難逾越的高山，我推薦兩個簡單迅速的方法： 一 網(wǎng)頁工具 https://biodbne...
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ChIP-Seq數(shù)據(jù)挖掘系列-4: liftOver - 基因組坐標在不同基因組注釋版本間轉(zhuǎn)換liftover 是UCSC提供的一個用于不同基因組注釋版本間基因組坐標轉(zhuǎn)換的工具。UCSC 提供了一個web版本；數(shù)據(jù)過多時用起來很不方便，也...
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