Protein domain： 結(jié)構(gòu)域的概念由Wetlaufer于1973年首次提出，他定義結(jié)構(gòu)域?yàn)榭梢宰詣?dòng)折疊的穩(wěn)定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)單位。過去，結(jié)...
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Motif和domain的區(qū)別 -
蛋白質(zhì)組學(xué)簡(jiǎn)介Introduction 蛋白質(zhì)組(proteome)是一個(gè)組織或細(xì)胞基因組中所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)的總和。蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)最初由...
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基于blast進(jìn)行GO功能注釋
目前GO注釋主要分為兩種方法，其一，序列相似性即blast，其二，結(jié)構(gòu)域相似性比對(duì)（InterProsScan），該方法在前面也提及過，本文就b...
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幾個(gè)預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)的在線工具
1.預(yù)測(cè)理化性質(zhì)：分子量(Da)、等電點(diǎn)(PI)\不穩(wěn)定系數(shù)(Instability index)、親水指數(shù)(Grand average of ...
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好用的小工具及數(shù)據(jù)庫(kù)資料做富集分析的網(wǎng)頁(yè)工具h(yuǎn)ttps://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost用法：把基因列表輸入就可以了, 如果基因的重要性有區(qū)...
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展示基因家族的結(jié)構(gòu)域
motif與domain motif（模體）是蛋白中較小的保守序列片段，概念比domain小。PROSITE是專門搜索蛋白motif的數(shù)據(jù)庫(kù)，其...
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單個(gè)基因的生物信息學(xué)分析(2)-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)本期的主題仍然屬于《單個(gè)基因的生物信息學(xué)分析》，主要講解介紹一下單個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析。 網(wǎng)站鏈接如下：InterPro 打開主頁(yè)面顯示如圖1，注...
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在線預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)PyMOL 蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的體現(xiàn)者，其結(jié)構(gòu)決定著功能。由線性氨基酸組成的蛋白質(zhì)需要折疊成特定的空間結(jié)構(gòu)才具有相應(yīng)的生理活性和生物...
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蛋白互作網(wǎng)絡(luò)PPI-1String【https://string-db.org/】 2019.11.22 拿到有參轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)，gene name 都是序列號(hào)，還不知...
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蛋白質(zhì)基礎(chǔ)分析
NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)常用四個(gè)子庫(kù): PubMed、BLAST、Nucleotide、Protein. 對(duì)于一個(gè)蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)分析: 1. 獲得蛋白質(zhì)序列...
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