TCGA風(fēng)險(xiǎn)模型類生信文章中，經(jīng)常會(huì)對(duì)高低風(fēng)險(xiǎn)組進(jìn)行16種免疫細(xì)胞和13種免疫功能評(píng)分的比較，就會(huì)用到一個(gè)29個(gè)免疫特征的基因集（16種免疫細(xì)胞和13種免疫功能評(píng)分），如下圖：
16種免疫細(xì)胞：aDCs（活化的樹突狀細(xì)胞）、B_cells（B細(xì)胞）、CD8+_T_cells（CD8+ T 細(xì)胞）、DCs（樹突狀細(xì)胞）、iDCs（未成熟的樹突狀細(xì)胞）、Macrophages（巨噬細(xì)胞）、Mast_cells（肥大細(xì)胞）、Neutrophils（中性粒細(xì)胞）、NK_cells（自然殺傷細(xì)胞）、pDCs（漿細(xì)胞樣樹突狀細(xì)胞）、T_helper_cells（輔助性T細(xì)胞）、Tfh（濾泡輔助性T細(xì)胞）、Th1_cells（Th1輔助細(xì)胞）、Th2_cells（Th2 輔助細(xì)胞）、TIL（腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞）、Treg（T調(diào)節(jié)細(xì)胞）。
13種免疫功能評(píng)分：APC_co_inhibition（抗原呈遞細(xì)胞公抑制）、APC_co_stimulation（抗原呈遞細(xì)胞共刺激）、CCR（CC趨化因子受體）、Check-point（檢查點(diǎn)）、Cytolytic_activity（細(xì)胞溶解活性）、HLA（人類白細(xì)胞抗原）、Inflammation-promoting（促炎）、MHC_class_I（主要組織相容性復(fù)合體 I類分子）、Parainflammation（副炎癥）、T_cell_co-inhibition（T細(xì)胞共抑制）、T_cell_co-stimulation（T細(xì)胞共刺激）、Type_I_IFN_Reponse（I型干擾素）、Type_II_IFN_Reponse（II型干擾素）
（圖片來(lái)源：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2023.1171811/full）
但是一般文章都沒有提供這個(gè)基因列表。2018年一篇文章"(Classification of triple-negative breast cancers based on Immunogenomic profiling)[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6310928/]"中附件1提供了基因集列表。
看看基因集長(zhǎng)什么樣。
基因集下載地址1：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6310928/bin/13046_2018_1002_MOESM1_ESM.xlsx
