GSEA

參考文章:GSEA的分析匯總 - 簡書;https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/78561937;GSEA-基因集富集分析 - 小xuo生 - 博客園

輸入數(shù)據(jù)準備參考Data formats - GeneSetEnrichmentAnalysisWiki

Expression Data Formats

使用最后一種TXT: Text file format for expression dataset (*.txt)格式(第一種試了好幾次會報錯,不知道為啥),excel制作,保存時存成tab-delimited text即制表符分隔文本文件


Phenotype data 用TeXStudio編寫,保存為cls格式,其中第二行三種類型順序與第三行各類型出現(xiàn)的順序一致,這樣不會報錯(若按#I II II,load時會報錯,不知道為啥)


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